Diversitas Mikroorganisme Pengoksidasi Amonia di Lahan Pertanian Gintungan

Nitrifikasi adalah suatu proses yang penting untuk menjaga kestabilan ekosistem karena nitrifikasi menyediakan sumber nitrogen yang dapat dikonsumsi oleh tumbuh-tumbuhan dalam bentuk nitrat. Nitrifikasi adalah proses dua tahap yang diawali oleh oksidasi amonia. Tanpa oksidasi amonia, nitrifikasi tidak dapat terjadi. Oksidasi amonia dilakukan oleh dua kelompok mikroorganisme pengoksidasi amonia, yang disebut archaea pengoksidasi amonia (APA) dan bakteri pengoksidasi amonia (BPA). Keragaman dan struktur mikroorganisme pengoksidasi amonia pada tanah telah lama dipertimbangkan sebagai faktor-faktor yang menentukan laju nitrifikasi. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari keragaman dan struktur dari APA dan BPA untuk mengetahui peran dari kelompok-kelompok ini dalam nitrifikasi di lahan pertanian Gintungan. Dalam penelitian ini, sampel DNA diekstraksi dari delapan seresah daun tanaman hortikultura yang berbeda yang didapatkan dari lahan pertanian Gintungan. Sampel DNA diamplifikasi menggunakan tiga set primer yang berbeda dan diprofilkan menggunakan Denaturant Gradient Gel Electrophoresis (DGGE). Keragaman mikroorganisme dihitung menggunakan Shannon-Weiner index. Hasil menunjukkan bahwa spesies tanaman menentukan keragaman dari APA dan BPA. APA lebih melimpah dan lebih beragam dibandingkan BPA, maka APA diindikasikan sebagai pemeran utama dalam nitrifikasi di lahan pertanian Gintungan