Prediksi Biosynthetic Gene Clusters Dari aktinomisetes yang Berpotensi sebagai Antimrsa (Methicillin resistant staphy lococcus aureus)

Methicillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) merupakan spesies yangsudah menunjukkan resistensi terhadap antibiotik golongan metisilin dan menimbulkanmasalah kesehatan. Aktinomisetes dikenal sebagai mikroorganisme penghasil metabolitsekunder termasuk antibiotik. Biosynthetic Gene Cluster (BGC) mengandung gen yangmenyandi semua enzim yang diperlukan untuk menghasilkan metabolit sekunder.Dengan pendekatan genome mining, BGC tersebut dapat diidentifikasi danmemungkinkan ditemukannya senyawa baru. Tujuan dari penelitian ini adalahmelakukan skrining potensi aktinomisetes sebagai anti-MRSA serta memprediksi BGCdari aktinomisetes yang memiliki potensi sebagai anti-MRSA. Tahapan penelitian inimeliputi peremajaan aktinomisetes, skrining potensi anti-MRSA, kultivasi aktinomisetes,pengamatan morfologi, isolasi DNA, amplifikasi gen 16S rRNA, sekuensing danidentifikasi spesies aktinomisetes, dan analisis potensi metabolit sekunder. Hasil skriningpotensi aktinomisetes menunjukkan tiga isolat yang teridentifikasi memiliki aktivitasanti-MRSA tertinggi yaitu W-5A, P-6B, dan W-5B dengan indeks penghambatan 0,58;0,53; dan 0,47. Hasil analisis BGC yang menyandi antibakteri menunjukkan isolat W-5Ayang teridentifikasi sebagai Streptomyces longisporoflavus memiliki satu BGC dengansimilaritas terhadap tetronasin. Isolat P-6B yang teridentifikasi sebagaiPseudarthrobacter siccitolerans memiliki satu BGC dengan similaritas terhadapdesferrioxamine E. Isolat W-5B yang teridentifikasi sebagai Streptomyces cellulosaememiliki delapan BGC dengan similaritas terhadap tiacumicin B, actinorhodin,ulleungmycin, albaflavenone, desferrioxamine B/desferrioxamine E, stenothricin,auricin, dan lugdunomycin