Virtual Screening Senyawa Anti-MRSA (Methicillinresistant Staphylococcus Aureus) dari Streptomyces dengan Metode Docking Molekul

Methicillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) merupakan bakteri penyebab utama infeksinosokomial di seluruh rumah sakit di dunia. Saat ini, terapi infeksi MRSA menggunakanceftaroline telah dilaporkan adanya resistensi. Untuk mengatasi resistensi tersebut maka eksplorasisenyawa antibiotik baru sebagai anti-MRSA menjadi penting dilakukan. Salah satu pendekatanvirtual screening senyawa bioaktif yang berpotensi sebagai obat baru adalah menggunakan metodedocking molekul. Sumber senyawa bioaktif yang potensial umumnya berasal dari genusstreptomyces yang merupakan bakteri utama penghasil antibiotik. Berdasarkan hal tersebut makatujuan penelitian adalah membandingkan interaksi protein PBP2a dengan PBP2a mutan terhadapceftaroline, serta screening senyawa bioaktif dari streptomyces sebagai kandidat anti-MRSA.Preparasi ligan menggunakan software Marvin, docking molekul menggunakan softwareautodock4, dan visualisasi hasil docking menggunakan software Discovery Studio. Hasilpensejajaran menunjukkan bahwa PBP2a mutan memiliki urutan asam amino yang lebih panjang(643 asam amino) dibandingkan PBP2a (641 asam amino). Pensejajaran PBP2a dan PBP2a mutanmenunjukan perbedaan urutan asam amino pada Rantai A dan rantai B. Mutasi yang terjadi padaPBP2a mutan menyebabkan perubahan konformasi pada sisi aktif PBP2a mutan sehingga interaksiantara ceftaroline dan PBP2a mutan menjadi berkurang. Hasil virtual screening menunjukanbahwa 1-acetyl-β-carboline merupakan senyawa yang paling potensial sebagai anti-MRSA denganenergi ikatan paling kuat yaitu -7,12 KKal/mol. Asam amino yang terlibat pada pengikatan senyawa bioaktif dengan PBP2a mutan adalah serin, treonin, asparagin, tirosin dan alanin