Early life respiratory and allergic profiles and their associated factors in French general population : findings from the ELFE (Etude Longitudinale Française depuis l'Enfance) cohort

La cohorte ELFE (2011) a recruté 18 329 enfants dans 320 maternités à travers la France avec des objectifs multidisciplinaires ; l'un d'entre eux étant de mieux comprendre les trajectoires respiratoires et allergiques en population générale. Afin d'atteindre l'objectif fixé, les analyses ont été menées en 3 parties : • Identifier les cas et les témoins pour l'étude cas-témoins (EBRA-ELFE) - L'effet de l'exposition domestique à de multiples micro-organismes au début de la vie sur le développement ultérieur de l'asthme n'est toujours pas résolu, probablement en raison du manque d'études utilisant un échantillonnage standardisé et une analyse environnementale ciblée. En 2011, la cohorte ELFE a déposé une procédure d'échantillonnage standardisée : collecteur de poussière électrostatique (EDC), dans les chambres à coucher de 3193 enfants à la naissance et ensuite analysé par qPCR pour 20 cibles (moisissures, acariens, bactéries etc.) basées sur le rôle allergène ou potentiellement protecteur dans les maladies allergiques. 27%- 88% de moisissures, 92-98% de bactéries et 48% d'acariens ont été détectés dans les logements et sur la base de 6 espèces de champignons, 1 famille et 2 genres de bactéries et 1 acarien, 6 profils de logements différents à travers la France ont été établis. Une nouvelle collecte de poussières de la cohorte après 5 ans de suivi, a été mise en place pour analyser les profils microbiologiques à l'âge de 5 ans, sur la même population sous la forme d'une étude cas témoins nichée au sein de la cohorte (60 enfants asthmatiques vs 60 non asthmatiques). La sélection des cas-témoins a été effectuée à partir de la population qui avait un EDC viable à la naissance (2011) et à l'âge de 5 ans (N= 1 753 ; 52% de garçons, 15% d'asthmatiques et 8% de propriétaires d'animaux). La détermination des cas était basée sur le diagnostic d'asthme, l'utilisation d'un inhalateur et les crises de sifflements (n=67). En revanche, les témoins étaient absolument exempts de maladie et de symptômes (non asthmatiques, pas d'hospitalisation pour des problèmes respiratoires, pas de toux, de rhinite, etc.) de la naissance à l'âge de 5 ans (n=402). Les cas et les témoins ont été appariés individuellement en fonction de la saison et de la région d'habitation. La vérification des profils microbiologiques des logements des cas et des témoins déterminés à l'âge de 5 ans est actuellement en cours par l’équipe de Besançon. • Étude de validation externe d'un score prédictif non invasif de l'asthme La présentation hétérogène des symptômes d'asthme peut contribuer au sous-diagnostic et au traitement de l'asthme préscolaire, ainsi qu'à l'augmentation de la morbidité et des hospitalisations des enfants asthmatiques sévères. Compte tenu de l'augmentation mondiale de la prévalence de l'asthme infantile, il est donc nécessaire de disposer d'outils pronostiques efficaces pour aider les praticiens. La Leicestershire Respiratory Cohort (LRC) a validé un outil simple et non invasif de prédiction de l'asthme en 10 points, facilement utilisable lors d'une seule consultation médicale. L'outil de prédiction de l'asthme a fourni à la cohorte ELFE une occasion unique de déterminer son utilité dans une grande population préscolaire présentant des symptômes hétérogènes. Nous avons constaté que l'outil LRC avait une bonne discrimination et une bonne calibration et qu'il était robuste aux modifications des critères d'inclusion et de résultats. • Identifier et caractériser les phénotypes de sifflements chez l’enfant d’âge préscolaire et de l'asthme et détailler leurs caractéristiques de 0 à 5 ans. Le phénotypage de l'asthme au début de la vie reste difficile à appréhender chez l’enfant. En France, le phénotypage de l'asthme pédiatrique sévère a fait l’objet de publications ; avec des résultats parfois divergents [...].The ELFE cohort (2011) recruited 18,329 children from 320 maternity units across France with multidisciplinary objectives; one of which is gaining a better understanding of respiratory and allergic trajectories in the general population. In order to achieve the stated objective, 3 tasks were undertaken: identify cases and controls for nested case control study (EBRA-ELFE) The effect of early life indoor exposure to multiple microorganisms and the subsequent development of asthma remains unresolved; possibly due to a lack of studies using standardized sampling and targeted microbial analysis. In 2011, the ELFE cohort deposited a standardized sampling procedure: electrostatic dust collector (EDC), in the bedrooms of 3193 children at birth and then analyzed by qPCR for 20 targets (molds, dust mites, bacteria etc.) based on either allergenic or potentially protective role in allergic diseases. 27%- 88 % molds, 92-98% bacteria and 48% mites were detected in dwellings and based on 6 fungal species, 1 family and 2 genera of bacteria and 1 dust mite, 6 different housing profiles across France were established. A new collection of dust from the cohort after 5 years of follow-up, were set up to capture microbial profiles at age 5 years, on the same population in the form of a nested case-control study (60 asthmatic vs. 60 non-asthmatic children). Case – control selection was done from the population that had a viable EDC at birth (2011) and at age 5 (N= 1,753; 52% boys, 15% asthmatic and 8% pet owners). Case determination was based on diagnosed asthma, use of inhaler medication and wheezing attacks (n=67). Contrastingly, controls were absolutely disease and symptom free (non- asthmatic, no hospitalization for respiratory issues, no cough, rhinitis etc.) from birth to age 5 (n=402). Cases and controls were individually matched on season and region of habitation. The ascertainment of the microbiological profiles of the dwellings of the determined cases and controls at age 5 is currently underway. External validation study of a non-invasive asthma predictive score Childhood asthma presents a diagnostic challenge due to its heterogeneous symptom presentation. 4 Such difficulties can contribute to under-diagnosis and treatment of preschool asthma, as well as increased morbidity and hospitalizations of severe asthmatic children. Given the globally increasing prevalence of childhood asthma, effective prognostic tools to aid clinical practitioners are thus needed. The Leicestershire Respiratory Cohort (LRC) proposed a simple non-invasive 10 item asthma prediction tool, easily usable in a single medical consultation. The asthma prediction tool provided ELFE cohort a unique opportunity to determine its utility in a large preschool population with heterogeneous symptom presentation and we found that the LRC tool had good discrimination and calibration and was robust to alterations in inclusion and outcome criteria. Identify and characterize preschool wheeze profiles and asthma phenotypes along with detailing their characteristics from age 0-5. Early life asthma phenotyping remains an unmet need in pediatric asthma. In France, severe pediatric asthma phenotyping has been done extensively; however, phenotypes in the general population remain underexplored. Based on the course and severity of respiratory/ allergic symptoms we aimed to identify and characterize early life wheeze and asthma profiles in the general population, using a supervised trajectory) and an unsupervised approach respectively. Data was collected using parental responses to modified versions of ISAAC questionnaire on eczema, rhinitis, food allergy, cough, wheezing, dyspnea and sleep disturbance due to wheezing at 3 time points: post-natal (2 months), infancy (age 1) and pre-school (age 5) [...]