Regulation of cellular and viral microRNAs accumulation upon mouse cytomegalovirus infection

Les virus de la famille des herpesviridae, tels que le cytomégalovirus murin (MCMV), peuvent exprimer leurs propres micro-(mi)ARN, ils sont également capables de déréguler l'expression des miARN cellulaires. Bien que le profil global d'expression des miARN cellulaires ne soit que très modestement perturbé dans les cellules infectées par le MCMV; l'accumulation d'un miARN particulier, miR-27a, est très fortement régulée au cours de l'infection. Il est intéressant de noter que cette régulation semble se dérouler au niveau de la stabilité de la forme mature du miARN. Ainsi, le but de ce travail de thèse fut l'identification de facteurs à la fois viraux et cellulaires impliqués dans la régulation de miR-27. De plus, nous avons cherché à identifier de manière globale de potentielles activités enzymatiques impliquées dans la régulation de la stabilité des miARN. Nous avons à ce titre étudié le rôle de la terminal uridyl transférase TUT1 chez Arabidopsis thaliana ainsi que celui d'un de ses homologues chez les mammifères, Zcchc6. Bien que nos efforts pour établir le rôle de ces protéines dans la modification des miARN ne furent pas complètement concluants, nous avons établi les bases du mécanisme par lequel miR-27 est dégradé via son appariement à un abondant transcrit viral.Viruses from the herpesviridae family, such as the mouse cytomegalovirus (MCMV), are known for expressing their own micro (mi)RNAs, but they can also perturb the expression of cellular miRNAs. Although the cellular miRNA profile is only modestly impacted in MCMV infected cells, one particular miRNA, miR-27a is dramatically down-regulated upon infection. Interestingly, the regulation of this miRNA seems to be at the level of the stability of the mature form. The goal of this thesis was to identify viral and cellular factors involved in miR- 27 regulation. In addition, we also looked more broadly for potential enzymatic activities involved in the regulation of the stability of miRNAs. Therefore, we studied the role of the terminal uridyl transferase TUT1 in Arabidopsis thaliana and of one of its homolog, Zcchc6, in mammalian cells. Although our efforts to establish the role of these proteins in the modification of miRNAs were not fully conclusive, we could get insights into the mechanism by which miR-27 is degraded via pairing to an abundant viral transcript