Análisis de la expresión de un elemento viral endógeno derivado de parvovirus en Cavia porcellus

Tesis (Magíster en Biotecnología y Ciencias de la Vida)Un Elemento Viral Endógeno (EVE) es una secuencia de origen viral presente en el genoma de alguna especie capaz de heredarse verticalmente. Podemos encontrar EVEs representantes de las 7 clases de genomas viral como por ejemplo EVEs derivados de virus ADN monohebra de la familia Parvoviridae. Alguno de estos EVEs mantienen ORF completos y las proteínas codificadas en estos pueden cumplir una función en la célula. Nuestro laboratorio y otros han descrito EVEs parvovirales que se expresan en el hígado de Octodon degu y Elephas Maximus. En otros mamíferos como Cavia porcellus se han reportado la existencia EVEs parvovirales pero no se han demostrado que se expresen. Nosotros encontramos un EVE parvoviral en el genoma de Cavia porcellus, se predijo en la base de datos de EST que se encontraría expresando en forma de fusión a 5 exones homólogos a miosina 9 (XM_013153010.2). Este EVE posee 40% de identidad con la proteína parvoviral NS y 55.19% de identidad con el EVE identificado en O. degu. Este EVE es un ORF intacto que codifica una proteína con dominios NS y Miosina 9. En esta tesis nosotros demostramos que efectivamente NS-Myo9 se expresa en forma de fusión y posee un splicing levemente diferente a lo predicho en la base de datos de EST. Por otra parte, se clonó la secuencia codificante NS-Myo9 y en vectores de expresión y se logró traducir una proteína a partir del ORF de NS-Myo9 y además se observó la localización subcelular de NSMyo9 encontrando que esta posee una localización citoplasmática. Esta es la primera descripción de un elemento viral endógeno derivado de parvovirus reportado que se transcribe en forma de fusión a un gen celular, este hallazgo abre las puertas a estudiar el posible rol que esté cumpliendo esta proteína en Cavia porcellus