Potensi Pemanfaatan Teknik Molekuler Berbasis DNA dalam Penelitian Penyakit Bulai pada Jagung: Potensi Pemanfaatan Teknik Molekuler Berbasis DNA dalam Penelitian Penyakit Bulai pada Jagung

Downy mildew is one of the major diseases in maize that may decrease maize production in Indonesia. Downy mildew in maize is caused by Peronosclerospora spp. that are obligate parasites that cannot be grown in a synthetic growth medium. Efforts to control the disease by using resistant maize varieties and fungicides often did not give the expected results, this might be due to the variations of the pathogen that have diverse nature and responses. Identification and the understanding of the biodiversity of downy mildew are major key aspects in efforts to control the disease. The Identification of species morphologically is often difficult due to the limited distinguishing characteristics and close similarities between them. Molecular biology methods are now starting to be widely used because they can provide information about the diversity of an organism genetically quickly and accurately. Therefore molecular biology methods can be used to support the morphological observations. The use of molecular markers such as RAPD, RFLP, AFLP, and SSR as well as direct sequencing of specific DNA regions (rDNA, ITS region of rDNA and mtDNA) can represent the diversity of downy mildew. In Indonesia, generally, there are three main species that cause downy mildew in maize i.e, P. philippinensis, P. maydis and P. sorghi. In the future, the use of new molecular biology techniques may provide more information faster and accurately that may be able to open more possibilities for disease control efforts.Penyakit bulai merupakan salah satu penyakit utama yang menyerang tanaman jagung yang dapat menurunkan produksi jagung di Indonesia. Penyakit bulai pada jagung disebabkan oleh Peronosclerospora spp. yang bersifat parasit obligat sehingga tidak dapat ditumbuhkan di media kutur sintetik. Upaya pengendalian penyakit dengan penggunaan varietas  jagung yang tahan penyakit bulai dan penggunaan fungisida seringkali tidak memberikan hasil yang diharapkan, karena patogen penyebab penyakit bulai yang beragam jenisnya sehingga memberikan respon yang berbeda pula. Identifikasi dan pemahaman tentang biodiversitas patogen penyebab penyakit bulai sangat penting dalam upaya pengendalian penyakit bulai. Identifikasi spesies secara morfologis terkadang sulit dilakukan karena karakter pembeda yang terbatas dan  mirip. Metode biologi molekuler saat ini mulai secara luas digunakan, karena dapat memberikan informasi keragaman dari suatu organisme secara genetik secara cepat dan akurat. Oleh karena itu metode biologi molekuler dapat digunakan untuk mendukung hasil pengamatan secara morfologis. Penggunaan marka molekuler seperti RAPD, RFLP, AFLP dan SSR serta sekuensing region DNA tertentu (rDNA, region ITS rDNA dan mtDNA) secara langsung dapat menggambarkan keanekaragaman patogen penyakit bulai. Di Indonesia terdapat tiga spesies utama penyebab bulai yaitu P. philippinensis, P. maydis dan P. sorghi. Kedepan penggunaan teknik-teknik biologi molekuler baru dapat memberikan informasi yang lebih banyak, cepat, dan akurat akan dapat membuka lebih banyak kemungkinan bagi upaya pengendalian penyakit ini