Utvikling av mikrosatellitt multipleks PCR for genetiske studier av Margaritifera margaritifera

Norsk: Den utrydningstruede elvemuslingen (Margaritifera margaritifera) er en viktig nøkkeart i økosystemet den lever i. De siste hundre årene har det imidlertid vært en sterk nedgang i antall individer og populasjoner av elvemusling over hele Europa. Utvikling av polymorfe mikrosatellittmarkører vil kunne benyttes til kartlegging av genetisk variasjon for norske elvemusling populasjoner, og være et viktig verktøy til utarbeidelse av bevaringsbiologiske tiltak for elvemusling i Norge. Ved bruk av 454-sekvenseringsteknikk fikk vi identifisert 201 mikrosatellittloci, hvor 17 ble evaluert for inkludering i et multipleks PCR-oppsett. Kostnader ved genotyping er betydelige, derfor utviklet og optimaliserte vi to multipleks PCR-reaksjoner med henholdsvis 6 nyutviklede og 5 etablerte markører i PCR-reaksjonene. Et begrenset populasjonsstudie på 132 individer fra 5 populasjoner ble utført. Resultater viser at alle markørene er polymorfe, med gjennomsnittlig allelantall på 4,5 allel per loci. 4 av populasjonene viste svært liten genetisk variasjon og hadde flere monomorfe loci (gjennomsnittlig He: 0,02 – 0,15), mens den siste populasjonen viste god genetisk variasjon (gjennomsnittlig He: 0,53). Tester og analyser viste at markørene ga reproduserbare resultater med lav feilrate, utenom for to av markørene (Mm2235 og MarMa5167), som bør evalueres mer nøye. Dette studiet viser at det å utvikle multipleks PCR-oppsett for genotyping av elvemusling er oppnåelig