Application of Hidden Markov Models to evaluation of fish vertical movement.

In this master thesis I am processing unique position data regarding fish movement of wels Silurus glanis obtained by an acoustic telemetry system in lake Milada. Im conducting an experiment of using MS-GARCH models in non economic sphere to determine state of fish vertical activity. Activity is then explained by environmental factors using logistic regression with dynamic structure on long time series. Models show 2 different activity patterns defined by different volatilities. Wels is decreasing his activity during day and increasing during dusk and night period.Tato diplomová práce zpracovává unikátní data o pohybu ryb nasbíraných pomocí metody akustické telemetrie na jezeře Milada. Provádím experiment užití MS-GARCH modelů mimo finanční sféru, pomocí kterých určuji aktivní stav ryb, konkrétně vertikální aktivitu sumce Silurus glanis. Aktivita je dále vysvětlována environmentálními faktory pomocí logistické regrese s dynamickou strukturou na dlouhých časových řadách. Modely ukazují 2 rozdílné režimy aktivity definované rozdílnou volatilitou. Sumec velký snižuje aktivitu ve dne a zvyšuje za soumraku a v noci