Polimorfisme DNA Ikan Nilem (Osteochilus Vittatus) berbeda Ukuran yang Dibudidayakan di Beji dan Singosari Kabupaten Banyumas

Budidaya ikan nilem (Osteochilus vittatus) dapat ditingkatkan dengan melakukan seleksi berdasarkan perbedaan karakteristik genetik yang dikenal dengan sebutan polimorfisme DNA. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mengetahui polimorfisme DNA ikan nilem (Osteochilus vittatus) dengan laju pertumbuhan yang berbeda menggunakan teknik RAPD. Ikan yang digunakan berasal dari Desa Beji dan UPT BBI Singosari sebanyak 6 ekor dari setiap tempat, kemudian dari masing-masing asal ikan dibagi menjadi dua kelompok berdasarkan ukuran. Ikan nilem diukur Truss Morfometrik, setelah itu dilakukan isolasi DNA dan diamplifikasi menggunakan primer OPA-03, OPA-11 dan OPA-13 kemudian dielektroforesis. Hasil penelitian menunjukan pada primer OPA-13 muncul pita pada ukuran 460 bp yang hanya ditemukan pada sampel ikan nilem ukuran besar. Berdasarkan analisis PyElph, pada sampel ikan nilem dengan primer OPA-13 pohon filogenik terbentuk menjadi dua kluster yang terbagi berdasarkan kelompok ukuran. Teknik RAPD menggunakan primer OPA-13 menampilkan polimorfisme DNA ikan nilem yang dapat membedakan ikan nilem berdasarkan laju pertumbuhan yang lebih baik dengan persentase kemunculan pita DNA 83,3%