Identifikasi Bakteri Potensial Lahan Marginal Secara Molekuler Menggunakan 16s Rrna Dan Uji Bioassay Pada Padi Potensial Lahan Marginal

Berdasarkan penelitian sebelumnya diketahui isolat bakteri GT-2 dan SR-1 memiliki potensi sebagai PGPR. PGPR merupakan kelompok bakteri pada area akar yang memberi keuntungan bagi pertumbuhan tanaman. Pemanfaatan bakteri pada tanah dapat meminimalkan penggunaan pupuk karena unsur hara menjadi tersedia bagi tanaman sehingga lebih efisien. Adanya potensi yang baik bagi pertumbuhan tanaman mendorong untuk melakukan uji lebih lanjut mengenai identitas bakteri, pengujian PGPR pelarut fosfat dan penambat nitrogen, serta pengujian bioassay. Penelitian ini bertujuan untuk 1) Menentukan identitas dari bakteri GT-2 dan SR-1 melalui analisis bioinformatik sekuen 16S rRNA, 2) Mengetahui kemampuan PGPR isolat GT-2 dan SR-1 dalam pelarutan P dan penambat N, 3) Menentukan isolat terbaik yang memiliki respon optimal terhadap pertumbuhan varietas padi lahan marginal. Penelitian dilaksanakan dari bulan Oktober 2018 hingga Maret 2019 di laboratorium Agroekologi, Agrohortikultura, Perlindungan Tanaman Fakultas Pertanian, Universitas Jenderal Soedirman. Tahapan yang dilakukan dalam penelitian ini adalah peremajaan isolat murni, isolasi DNA, pengujian kualitas dan kuantitas DNA, amplifikasi 16S rRNA dengan teknik PCR, visualisasi pita DNA, purifikasi DNA hasil PCR, sekuensing DNA, analisis bioinformatika, analisis filogenetika, uji bakteri pelarut P dan penambat N serta uji bioassay respon tanaman terhadap isolat bakteri GT-2 dan SR-1. Variabel yang diamati dari pengujian biomolekuler meliputi konsentrasi DNA hasil isolasi, tingkat kemurnian DNA hasil isolasi, ukuran pita DNA hasil PCR, urutan nukleotida 16S rRNA. Variabel yang diamati dari uji bakteri pelarut P dan penambat N yaitu hasil positif dan negatif. Sedangkan variabel yang diamati dari pengujian bioassay meliputi tinggi tanaman, jumlah daun, panjang akar, bobot basah tanaman, dan bobot kering tanaman. Hasil pengamatan didapatkan konsentrasi dan kemurnian DNA hasil isolasi pada isolat GT-2 sebesar 1,88 dan 361,4 serta isolat SR-1 sebesar 1,87 dan 175,9 hal ini menunjukkan konsentrasi DNA dapat digunakan untuk kegiatan PCR. Kegiatan PCR didapatkan hasil dengan ukuran pita DNA berkisar 1400 bp, ukuran sesuai dengan teknik 16S rRNA sehingga dapat dilakukan sekuensing. Hasil dari sekuensing DNA isolat GT-2 dan SR-1 mengidentifikasikan bahwa isolat GT-2 merupakan Bacillus proteolyticus dan isolat SR-1 merupakan Bacillus albus. Isolat bakteri GT-2 dan SR-1 positif sebagai pelarut fosfat namun negatif sebagai penambat nitrogen. Hasil pengujian bioassay respon tanaman terhadap perendaman benih pada larutan isolat konsentrasi 10 menunjukkan bahwa isolat terbaik yaitu GT-2. -