Using DNA Barcoding for delimitation of species in sigmodontine rodents (Cricetidae) in north Argentina with special emphasis on those of the Yungas forest

En esta investigación usamos códigos de barras de ADN como una herramienta para el análisis de la diversidad específica y la variabilidad geográfica de roedores Sigmodontinae (Cricetidae) en el Norte de Argentina. Analizamos 162 individuos de 50 localidades pertenecientes a 31 especies originalmente determinadas mediante morfología. El 72% de las localidades estudiadas se encuentran en las Yungas mientras que el 71% de las especies analizadas habita en alguno de sus estratos altitudinales. Se realizaron dos análisis de delimitación de especies: la implementación bayesiana del método “Poisson Tree Processes” (bPTP) y el método “Automated Barcode Gap Discovery” (ABGD), este último bajo dos modelos de sustitución, K2P y JC69. El método bPTP evidenció linajes diferentes en algunas especies totalizando un recuento de 44 especies, 13 más que las 31 originalmente detectadas. El método ABGD resultó en 40 especies en promedio para todas las particiones recursivas de los dos modelos de sustitución utilizados. Las especies que presentaron más de un linaje genético (especies putativas) con respecto a su determinación original fueron las siguientes: Akodon budini, Akodon simulator, Akodon spegazzinii, Andinomys edax, Necromys lactens, Oligoryzomys chacoensis, Oligoryzomys flavescens y Phyllotis tucumanus. Los resultados obtenidos sugieren una diversidad de roedores sigmodontinos más elevada que la actualmente reconocida en la región de estudio y destacan la necesidad de relevamientos faunísticos más exhaustivos que permitan un apropiado inventario de la biodiversidad.We used DNA barcodes to explore the species diversity and the geographic variability of Sigmodontinae (Cricetidae) rodents in North Argentina. We analyzed 162 individuals from 50 localities belonging to 31 species primarily determined by morphology. Most of the studied localities (72%) are from the Yungas forest while 71% of the analyzed species inhabit some of their altitudinal strata. We performed two species delimitation analyzes, the Bayesian Poisson Tree Processes (bPTP) method, and the Automated Barcode Gap Discovery (ABGD) method, the latter under two substitution models K2P and JC69. The bPTP method reported the presence of different lineages in some species totaling 44 species, 13 more than the 31 originally listed in our database. The ABGD method resulted in 40 species on average for all recursive partitions under the two substitution models. The following species presented more than one genetic lineage (putative species): Akodon budini, Akodon simulator, Akodon spegazzinii, Andinomys edax, Necromys lactens, Oligoryzomys chacoensis, Oligoryzomys flavescens and Phyllotis tucumanus. Our results suggest that the diversity of sigmodontine rodents in northwestern Argentina is higher than the currently recognized, and highlight the need for more exhaustive faunal surveys which allows a more accurate biodiversity inventoryFil: Andrade, Lautaro Daniel. Universidad Nacional de Jujuy. Instituto de Ecorregiones Andinas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Ecorregiones Andinas; ArgentinaFil: Martínez, Juan José. Universidad Nacional de Jujuy. Instituto de Ecorregiones Andinas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Ecorregiones Andinas; ArgentinaFil: Barquez, Ruben Marcos. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo. Programa de Investigación de Biodiversidad Argentina; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán; ArgentinaFil: Martín, Eduardo. Universidad Nacional de Jujuy. Instituto de Ecorregiones Andinas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Ecorregiones Andinas; ArgentinaFil: Ferro, Luis Ignacio. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo. Programa de Investigación de Biodiversidad Argentina; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán; Argentin