Genotypic and phenotypic characterization of newly isolated or commercially available phages targeting Pseudomonas aeruginosa

Caratterizzazione fenotipica e genotipica di nuovi fagi isolati di Pseudomonas aeruginosa a partire dalla raccolta di campioni ambientali. Valutazione dell’attività litica dei nuovi fagi nei confronti di un pannello di isolati clinici di Pseudomonas aeruginosa ottenuti da laboratori membri del consorzio europeo ANTIBIO-LAB e identificazione di un cocktail fagico. Miglioramento dell’attività litica in vitro mediante cicli ripetuti di infezione. Estrazione dei genomi fagici e seguente analisi bioinformatica con annotazione. Caratterizzazione delle interazioni fago-ospite usando come modello di infezione un caso di terapia fagica personalizzata. Valutazione della capacità dell’ospite batterico di formare biofilm e studio dell’attività litica del fago da solo o in combinazione con Meropenem. Genotypic and phenotypic characterization of newly isolated phages targeting Pseudomonas aeruginosa starting from the collection of environmental samples. Evaluation of the lytic activity of the novel phages towards a panel of Pseudomonas aeruginosa clinical isolates obtained from laboratories members of the European consortium ANTIBIO-LAB and identification of a phage cocktail. Improvement of the lytic activity in vitro through multiple cycles of infection. Phage genome extraction and following bioinformatic analysis with annotation. Characterization of phage-host interactions using a case of personalized phage therapy as infection model. Assessment of the bacterial host capability to form biofilm and investigation of the lytic activity of the phage alone or in combination with Meropenem