Extending quantitative genetic models to estimate mutational variance

Dette prosjektet introduserer utvidelser av dyremodellen, en type generalisert lineær blandet modell innen kvantitativ genetikk. Modellen utnytter informasjonen i en kjent slektskapsstruktur for dyre- eller plantepopulasjoner for å dele deres fenotypiske variasjon inn i miljøeffekter og additive genetiske effekter, samt å undersøke påvirkningen andre faktorer har på det fenotypiske trekket. I ville studiepopulasjoner kan dyremodellen hjelpe til med å skaffe spesifikk kunnskap som spesielt trengs innen konservering, for eksempel ved å kvantifisere evolusjonære responser på både naturlige og kunstige prosesser. Mutasjoner er foreslått som en forklaring på den kontinuerlige responsen i langvarige seleksjonseksperimenter hvor det forventes at et seleksjonsplatå er nådd. Som et verktøy til å utforske denne teorien, foreslår og undersøker vi en metode for å separere mutasjonsvarians fra andre kilder til additiv genetisk varians i dyremodellen, basert på den kjente slektskapsstrukturen. Som et eksempel, inkluderer vi mutasjonseffekter i en dyremodell med data fra en sangspurv-populasjon på øya Mandarte i Canada, implementert i de Bayesiske rammeverkene INLA og Stan. I tillegg benytter vi en resamplingsmetode for å se på årlige endringer i tilfeldige effekter og de tilsvarende variansene. Som forventet fra tidligere innsikt fra andre populasjoner, står den estimerte økningen i additiv genetisk varians, fra en generasjon til den neste, for en mindre del av den totale fenotypiske variansen, men resamplingen avdekker en rask økning over tid. Dette indikerer et overraskende stort tilskudd av additiv genetisk varians fra mutasjoner, men det finnes tegn til overestimering. Videre arbeid bør inneholde testing på simulerte data, noe som trolig vil vise at mutasjonsvariansen ikke er fullstendig separert fra andre additive genetiske effekter