Navigation et tourisme d'eau douce

Les voies navigables comtoises sont un bon exemple de la vétusté des équipements fluviaux. Elles totalisent 300 kilomètres de "voies d'eau Freycinet", caractérisées par une capacité maximale de 250 tonnes, limitant le volume de fret convoyé. Naguère actif, le trafic fluvial de marchandises est réduit aujourd'hui à une activité de transit dont l'impact économique sur la région est pratiquement nul. Gray, qui fut longtemps le premier port fluvial de la France de l'Est, reste le seul port comtois où l'on effectue encore l'embarquement de quelques produits agricoles (blé, fourrage et balles de paille). L'industrie lourde de la région, quant à elle, a délaissé la batellerie devenue obsolète