Epidemiological studies on ovine atypical scrapie

Atypical scrapie was discovered following the intensification of transmissible spongiform encephalopathy screening in small ruminants. The first evidences suggested that it could have a non infectious origin conversely to classical scrapie. This new type of scrapie raised questions on its dangerousness for men and animals and on its possible consequences on the efficacy of the scrapie control programs. The overall aim of the thesis was to describe the epidemiological situation of the disease in ovine and to describe the risk factors. We undertook a descriptive study based on surveillance data in France and in Europe, an exploratory study of the risk factors at the farm level and towards genetic risk and we studied the clustering of cases in space and in positive flocks. In most circumstances we compared our results with classical scrapie. The results of these studies were that atypical scrapie prevalence was quite similar between the different subpopulations compared, around six cases per ten thousands of animals tested, in contrast with classical scrapie which varied more. The genetic risk factors were strong and no risk factor associated with an infectious origin was identified. In addition the prevalence of atypical scrapie in positive flocks was not different from the prevalence in the general population and cases did not tend to cluster. These results supported the idea that atypical scrapie is not or hardly contagious which is compliant with a non infectious origin.La tremblante atypique a été découverte suite à l'intensification du dépistage des encéphalopathies spongiformes transmissibles des petits ruminants. Les premiers éléments disponibles suggéraient que cette forme pourrait ne pas être d'origine infectieuse, à la différence de la forme classique de tremblante. Cette nouvelle forme a soulevé des questions sur sa dangerosité pour l'homme et l'animal et ses conséquences sur l'efficacité des programmes de lutte contre la tremblante. L'objectif global de la thèse, était de décrire la situation épidémiologique de la maladie chez les ovins et d'en explorer les facteurs de risque. Nous avons entrepris une étude descriptive des résultats de la surveillance de la tremblante en France et en Europe, une exploration des facteurs de risque liés aux pratiques d'élevage et à la génétique ainsi qu'une étude de l'agrégation des cas sur le plan géographique et dans les troupeaux atteints. Dans la plupart des cas, nous avons comparé nos résultats à ceux obtenus pour la tremblante classique. Ces études ont montré que la tremblante atypique avait une prévalence assez homogène entre les différentes sous-populations comparées de l'ordre de six cas pour dix mille animaux testés, ce qui contrastait avec les résultats pour la tremblante classique, nettement plus variables. Les facteurs de risque génétique étaient marqués et aucun facteur de risque évoquant une origine infectieuse de la maladie n'a été identifié. De plus, la prévalenve de la tremblante atypique n'est pas différente dans les troupeaux atteints et dans la population générale et les cas n'avaient pas tendance à s'agréger. Ces résultats confortent l'idée que la tremblante atypique est peu ou pas contagieuse, ce qui est compatible avec une origine non infectieuse