Étude de la faune microbienne et des paramètres physico-chimiques du tractus digestif d’annélides oligochètes, récoltés à Ebebda et à Nkolbikogo (région du Centre Cameroun)

The study focuses firstly on the morphological analysis of ciliates and secondly the variation in abundance of acaryotes and prokaryotes of the digestive tract of annelids Oligochaetes collected in the Center Region of Cameroon. In addition, the physicochemical parameters that influence the seriation of these microorganisms along the digestive tract of their hosts were analysed.The morphological study is based on the techniques of impregnation of specimens with the ammoniacal silver carbonate, the DAPI and the Feulgen nuclear staining. The surveys carried out on the annelid oligochaetes of the family of Glossoscolecidae have anabled the description of twenty species of ciliates belonging to Heterotrichs, Hysterocinetidae and Astomes. Amoung Heterotrichs, have been described three species of the genus Nyctotherus characterized by the presence of an apical secant system on their right side and a species of the genus Nyctotheroïdes characterized by the existence of three secant systems on their two sides: one on the right side and two on the left. Up to now, the presence of Heterotrichs was unsuspected in Glossoscolecidae. In Hysterocinetidae, the description of nine new species demonstrates the existence of four different types of skeletal pattern. The first type, present four superimposed and antagonistic skeletal fibre layers, corresponds to that of the genus Ptychostomum. The second type is characterized by the existence of an unorganized field of fibrillary structures forming a dense and undivided mass in the central part of the suction cup, for which a new genus is created: Ptychostomoïdes. The third type, present in the genus Proptychotomoïdes, is characterized by the existence of a glabrous surface in the central area of the adhesive apparatus. In the genus Thurstonia, an uncialiated kidney shape surface bordered subsequently by two mobile lips deprived of skeletal fibers was observed. This morphological diversity within Hysterocinetidae requires a new approach of the systematic in this group. In some Astomes (Almophrya bivacuolata and A. mediovacuolata), the analysis of the morphological variations of the nuclear apparatus allowed us to highlight important digitations and the presence of dark bands in the H macro-nucleus structure of the small cellular types, as well as the presence of intermediate forms between H and X macronucleus in these two species. In Almophrya laterovacuolata, the disposition of the vacuolar apparatus is variable: either two longitudinal lines are arranged among branches of the H macronucleus, or two longitudinal lines are out of the H macronucleus branches. These longitudinal lines may also be arranged without obvious order among the H macronucleus branches. Given that the identification within the genus Almophrya is specifically based on the number and the arrangement of vacuoles, a revision of these criteria is required. Four new species belonging to genera Anoplophrya, Hoplitophrya and Dicontophrya were also described in Astomes.In addition to the description of two new genera in Hysterocinetidae, four species in Heterotrichs, and seven species in Astomes, the technique of the cytometry in flow enabled us to highlight an unsuspected population of viruses in the digestive tract of the Glossoscolecidae as well as a population of bacteria not less important.The technique of aspiration under a vacuum pump allowed us to isolate and collect the intestinal liquid in three portions of the digestive tract of Alma emini. The correlations carried out between physico-chemical parameters and ciliates biomass held our attention. These results suggest that each portion of the digestive tract of Alma emini is a set of biotope niches, and microhabitats in which a large number of physical and chemical factors create ecological niches more suitable to a species or a group of species. This might explain the striation and the variation of abundance of the microfauna along the digestive tract of oligochaetes annelids.L’étude porte sur les analyses morphologiques des Protozoaires Ciliés et sur la variation d’abondance de virus et de bactéries du tube digestif d’annélides oligochètes de la famille des Glossoscolecidae récoltés dans la région du Centre Cameroun. De plus, les paramètres physico-chimiques susceptibles d’influencer la sériation de ces microorganismes le long du tube digestif de leurs hôtes ont été analysés. L’étude morphologique est basée sur les techniques d’imprégnation des spécimens au carbonate d’argent ammoniacal pyridiné et à la coloration au Di Aminido Phenyl Indol. Les prospections effectuées ont permis la description de vingt espèces de Ciliés appartenant aux Hétérotriches, Hysterocinetidés et Astomes. Chez les Hétérotriches dont la présence jusqu'ici était insoupçonnée chez les Glossoscolecidae, trois espèces du genre Nyctotherus ont été décrites ; caractérisées par la présence d’un système sécant apical sur leur face droite. Une espèce du genre Nyctotheroïdes a été décrite. Elle est caractérisée par l’existence de trois systèmes sécants dont un apical sur la face droite et deux (apical et caudal) sur la face gauche. Chez les Hysterocinetidés, la description de neuf espèces nouvelles démontre l’existence, au niveau de l’appareil adhésif de quatre types différents de topographies d’armature squelettique. Le premier, qui présente quatre strates de fibres squelettiques superposées et antagonistes, correspond à celui du genre Ptychostomum. Le second est caractérisé par l’existence d’un champ inorganisé de structures fibrillaires formant une masse dense et indivise dans la partie centrale de la ventouse, pour lequel un nouveau genre est créé : le genre Ptychostomoïdes. Le troisième type se distingue du précèdent par l’existence d’une aire glabre dans la région centrale de l’appareil adhésif. En fin le quatrième type, caractéristique du genre Thurstonia présente une aire non ciliée réniforme bordée postérieurement par deux lèvres mobiles et dépourvue de fibres squelettiques. Cette diversification morphologique au sein des Hysterocinetidés semble devoir imposer une nouvelle approche de la systématique de ce groupe. Les Ciliés Astomes Almophrya bivacuolata et A. mediovacuolata sont caractérisés par un macronoyau soit en X, en H, soit intermédiaire entre X et H. L’étude des variations morphologiques de l’appareil nucléaire chez ces espèces d’Almophrya révèle d’importantes digitations, des bandes sombres et d’interbandes dans la structure du macronoyau en H des petits types cellulaires. Chez A. laterovacuolata, la disposition de l’appareil vacuolaire est très variable : deux rangées longitudinales entre les branches du macronoyau en H; deux rangées longitudinales hors des branches de celui-ci ; sans ordre évident entre ses branches. Une révision des critères d’identification des Ciliés Almophrya semble devoir s’imposer. Quatre espèces nouvelles appartenant aux genres Anoplophrya, Hoplitophrya et Dicontophrya ont également été décrites chez les Astomes. Par ailleurs, la technique de la cytométrie en flux nous a permis de mettre en évidence une population jusqu’alors insoupçonnée de virus dans le tractus digestif des vers Glossoscolecidae ainsi qu’une population non moins importante de bactéries. La technique d’aspiration sous une pompe à vide a permis d’isoler et de recueillir le liquide intestinal du tube digestif de Alma emini. Les corrélations effectuées entre les paramètres physico-chimiques et les variations d’abondances des Ciliés ont été significatives. Ces résultats laissent supposer que chaque portion du tractus digestif de Alma emini est un ensemble de biotopes, de microhabitats dans lesquels un grand nombre de facteurs physiques et chimiques créent des niches écologiques plus favorables à une espèce ou à un groupe d’espèces. Ceci expliquerait la sériation et la variation d’abondance de la microfaune le long du tube digestif des annélides oligochètes