Projet BiodivHealthSEA. Biodiversité et santé en Asie du Sud-Est

BiodivHealthSEA vise à étudier les impacts locaux des changements globaux (climat, usages des terres) sur les maladies zoonotiques infectieuses, au travers des changements de biodiversité. La perception locale des changements de biodiversité et de leurs liens à la santé est analysée au prisme de la gouvernance mondiale, des politiques publiques nationales et des actions des organisations non-gouvernementales dans les domaines sectoriels de la santé, de l'environnement, de la conservation et du développement (actions déclinées par le concept " One Health "). Le projet est localisé en Asie du Sud-Est (ASE), un point chaud d'émergence de maladies infectieuses à potentiel pandémique et de biodiversité particulièrement menacée en raison de changements d'utilisation des terres (Morand et al., 2014). L'ASE est au centre des attentions des organisations internationales, des agences de développement et des organisations non gouvernementales de conservation en raison du caractère global affectant la biodiversité et la santé. L'ASE est un modèle générique pour étudier localement la perception et les effets des changements globaux et de la gouvernance mondiale sur les interactions entre biodiversité et santé. Les rongeurs sont pris comme modèles pour d'une part étudier les changements de biodiversité et, d'autre, part en raison de leur rôle important comme réservoirs de nombreuses maladies zoonotiques (leptospirose, typhus des broussailles, peste, etc.) (Jiyipong et al., 2013). L'ASE est un centre de diversification pour les rongeurs muridés, qui s'avèrent être de bons indicateurs des modifications des habitats (Pagès et al. 2013). Les rongeurs font l'objet d'une chasse traditionnelle et pour certaines espèces d'un commerce transnational. Les rongeurs sont donc particulièrement appropriés pour étudier les relations entre les humains et leur environnement, tout en évaluant la santé liée aux maladies transmises par les rongeurs. Les objectifs de BiodivHealthSEA sont d'analyser (1) les impacts locaux des changements globaux sur les maladies zoonotiques en lien aux modifications de biodiversité et d'impacts des changements environnementaux, (2) et les perceptions locales des changements environnementaux et de la biodiversité en prenant en compte " l'architecture de la gouvernance globale ", les politiques publiques nationales et les actions des ONG dans les domaines sectoriels de la santé, de la conservation et de l'aménagement tes territoires. Le projet BiodivHealthSEA nécessite de gérer et de lier des données issues de la diversité biologique (identification spécifique, variabilité génétique neutre et sélectionnées, phénotype, traits de vie, etc), des maladies infectieuses et parasitaires (phénotypage des agents, génétique), anthropologiques (questionnaires, interviews) et devant s'appuyer sur de nombreuses données externes et hétérogènes (biogéographiques, de santé publique et animale, climatiques, socio-économiques, etc). Nous avons choisi les bases de données NoSQL (schemaless) triplestores car elles permettent de gérer le linked data et acceptent les requêtes " cross-database ". (Résumé d'auteur