Molecular characterization of dengue circulating in Pernambuco: epidemiological implications

Dengue (DENV) é a arbovirose de maior prevalência em humanos no mundo. Estudos moleculares são necessários para melhor entendimento de sua origem e história evolucionária. Análises filogenéticas e epidemiológicas sugerem que genótipos mais virulentos estão substituindo os de menor impacto epidemiológico. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar geneticamente os sorotipos 1, 2 e 3 do DENV isolados no estado de Pernambuco, de 1995 a 2010, através do sequenciamento e análise de variações do genoma completo do vírus. Os isolados de DENV-1 foram incluídos no genótipo V e três linhagens foram observadas: a linhagem I se relacionou com a cepa BR-90, oriunda do Rio de Janeiro; a linhagem II com isolados da Colômbia e Venezuela; a linhagem III mostrou relação com cepas das Ilhas Virgens e de Cingapura, sugerindo possível origem a partir do Caribe e/ou Ásia. Para o DENV -2 foi identificado o genótipo Sudeste Asiático/Americano. Duas linhagens foram observadas, a linhagem I teve sua origem provável a partir da Venezuela e foi substi tuída pela linhagem II, que possivelmente se originou da Jamaica. Os isolados de DENV-3 foram incluídos no genótipo III cuja origem possivelmente se deu pela introdução de uma cepa do Rio de Janeiro, oriunda das ilhas do Caribe. Substituições em nucleotídeos e aminoácidos foram encontradas ao longo dos genomas, as quais podem estar envolvidas em importantes alterações em funções das proteínas virais, mas nenhuma associação com a forma clínica da doença ou tipo de infecção foi identificada. Apenas alterações nucleotídicas em 5´UTR de DENV-3 previu estrutura secundária diferente. Alterações nucleotídicas e estruturais em 3´UTR não se relacionaram com a gravidade da doença. A pressão evolucionária observada foi seleção purificadora. Foram identificadas mutações que são específicas dos isolados e/ou linhagens de Pernambuco, que podem ser elementos virais genéticos que contribuem para sua contínua circulação na região e seu potencial epidêmic