Association of polymorphisms of cytokine genes with susceptibility to mycobacterial infection

Os estudos de polimorfismos dos genes de citocinas podem ser utilizados como uma ferramenta de anÃlise antropolÃgica para determinar perfis genÃticos distintos, para traÃar relaÃÃes entre populaÃÃes e para promover o entendimento das disparidades raciais na susceptibilidade genÃtica a doenÃas. O objetivo deste estudo foi correlacionar os polimorfismos das citocinas, TNF-&#945; -308, TGF-&#946;, cÃdon 10 e cÃdon 25, IL-10 -1082, -819, -592, IL-6 -174, e IFN-&#947; +874 com a susceptibilidade e a proteÃÃo Ãs infecÃÃes por M. tuberculosis e M. leprae. A casuÃstica incluiu 194 pacientes, sendo 65 com hansenÃase e 129 com tuberculose. Como controles foram selecionados 168 voluntÃrios saudÃveis. Todos os indivÃduos assinaram termo de consentimento informado e o estudo foi aprovado pelo Comità de Ãtica local. Para a obtenÃÃo do DNA genÃmico e amplificaÃÃo foram coletados 3-5ml de sangue perifÃrico, sendo utilizado na extraÃÃo do DNA o kit Easy-DNA (Invitrogen). Os SNPs dos genes das citocinas TNF-&#945; (-308G>A), TGF-&#946; cÃdon 10 e 25, IL-10 (-1082G>A, -819C>T, -592C>A), IL-6 (-174G>C) e IFN-&#947; (+874T>A) foram tipificados por reaÃÃo em cadeia da polimerase, empregando-se iniciadores de seqÃÃncia especÃfica (PCR-SSP) (One-Lambda). Utilizou-se para a anÃlise estatÃstica o programa GraphPad prism 5, sendo o valor de &#961; determinado atravÃs do Teste de Fisher bicaudal com significÃncia em &#961;<0,05. Durante a comparaÃÃo dos resultados entre os grupos estudados observou-se que nÃo houve diferenÃas entre as freqÃÃncias dos genÃtipos de TNF&#945;. Entretanto, na anÃlise dos genÃtipos de IL10, houve uma reduÃÃo da freqÃÃncia do GCC/GCC nos casos (7,1% vs 17,9%, p=0,006). Esta reduÃÃo tambÃm foi observada quando analisados os genÃtipos IL-6 GC (22,1% vs 32,8%, p=0,04) e IFN&#947; TA (36,6% vs 51,6%, p=0,01). No entanto, as freqÃÃncias dos genÃtipos GG de IL-6 (72,1% vs 57,0%, p=0,008) e AA de IFN&#947; (54,0% vs 41,4%, p=0,03) estavam aumentadas nos casos. Ademais, houve uma tendÃncia para aumento da freqÃÃncia do CC/GC de TGF&#946; (7,5% vs 0,8%, p=0,06). Dessa forma pode-se concluir que os genÃtipos: IL-10 (GCC/GCC), IL-6 (GC) e IFN-&#947; (TA) conferiram efeito protetor, enquanto os genÃtipos TGF-&#946; (CC/GC), IL-6 (GG) e IFN-&#947; (AA) conferiram efeito de susceptibilidade para infecÃÃo por micobactÃrias. Por outro lado, os alelos T no cÃdon 10 e G no cÃdon 25 de TGF-&#946; determinaram efeito protetor contra tuberculose. Em contraste, o alelo -174G de IL-6 determinou susceptibilidade Ãs infecÃÃes por micobactÃrias.Cytokine genetic polymorphisms studies are helpful to determine diverse genetic profiles, to correlate populations, and to promote the knowledge of ethnic influence on the genetic susceptibility to diseases. The aim of the present study was to correlate TNF-&#945; -308, TGF-&#946;, codon 10 and codon 25, IL-10 -1082, -819, -592, IL-6 -174, and IFN-&#947; +874 polymorphisms with the susceptibility and the protection to M. tuberculosis and M. leprae infection. The study included 194 patients, 65 of them with leprosy and 129 with tuberculosis, and 168 healthy volunteers. The local Ethical Committee approved the study and all of the participants consented. To DNA purification and amplification 3-5 mL of peripheral blood was collected. An Easy-DNA (Invitrogen) kit was used to purification. Cytokines SNPs TNF-&#945; (-308G>A), TGF-&#946; codon 10 and 25, IL-10 (-1082G>A, -819C>T, -592C>A), IL-6 (-174G>C) and IFN-&#947; (+874T>A) were amplified by the polymerase chain reaction using sequence-specific primers (SSP-PCR) (One-Lambda). Statistical analysis was proceeded using GraphPad prism 5, and p values were determined by the Fisher test, with significance when p