Efficiency and diversity of nodulating bacteria isolated of soils under old secondary forest and pasture in the Western Amazon.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência simbiótica e a diversidade fenotípica e genética de bactérias que nodulam leguminosas obtidas através da planta isca caupi [Vigna unguiculata (L.) Walp], de solos sob floresta secundária em estágio avançado de regeneração e pastagem na Amazônia Ocidental. As estirpes de bactérias fixadoras de N2 utilizadas no presente trabalho foram isoladas de nódulos obtidos através da inoculação de suspensões de solos (10-1), oriundos de dois sistemas de uso da terra, sendo obtidas 122 estirpes oriundas de solos sob floresta secundária e 159 estirpes de solos sob pastagem. A autenticação e a eficiência simbiótica foram verificadas no mesmo experimento. A autenticação teve como objetivo verificar a capacidade nodulífera no hospedeiro original, caupi. Para análise de autenticação e eficiência simbiótica foram realizados três experimentos com caupi cultivar BR-17 Gurgueia, de fevereiro a agosto de 2005, utilizando-se delineamento inteiramente casualizado. A análise estatítica foi realizada por meio do teste de Scott-Knott, utilizando o programa Sisvar. Como controles foram utilizadas as estirpes recomendadas para o caupi INPA 03-11B e Ufla 03-84 e plantas sem inóculos com nitrogênio e sem nitrogênio. Foram avaliados massa seca da parte aérea (MSPA), número (NN) e massa seca de nódulos (MSN), e eficiência relativa expressa pela fórmula Efr = (MSPAinoculada / MSPA com nitrogênio) x 100. Durante o experimento, 10, 20 e 30 dias após plantio, foram avaliado os sintomas de deficiência de nitrogênio, por meio do critério visual. A diversidade fenotípica dos isolados foi avaliada por meio de análise de proteínas totais SDS-PAGE. Os índices de diversidade de Shannon e o índice Chao1 foram usados para estimativas de riqueza. Também se realizou uma análise de rarefação com base nas características fenotípicas (proteína total) de modo a permitir a comparação entre as duas áreas. Os dois sistemas de uso da terra apresentaram isolados eficientes, sendo que os isolados 88AB3, 90C1, 90A4, 90A8, 88AB10a, 88AB6, 88A10 e 88AC2 do SUT floresta secundária e 83C3 da pastagem foram equivalentes à estirpe recomendada, ou à adubada com N mineral. O aparecimento de clorose nas plantas só foi detectado após 20 dias de plantio, caracterizando estes isolados como ineficientes. O perfil protéico dos isolados revelou uma grande diversidade. Na floresta secundária em estágio avançado de regeneração foram formados quatro grupos a 100% de similaridade e na pastagem, cinco. A partir dos grupos formados a 100% de similaridade, os próximos grupos foram formados a 92% (94 grupos) e 90% (62 grupos) de similaridade nos SUT floresta secundária e pastagem, respectivamente, e os últimos, a 8% (1 grupo) e 9% (3 grupos) de similaridade em floresta secundária em estágio avançado de regeneração e pastagem, respectivamente. A diversidade de bactérias que nodulam caupi, mostrada pelos dendogramas de similaridade nos dois SUT analisados, foi comprovada pelo índice de diversidade de Shanon, visto que o número de isolados obtidos em cada uma delas (tamanho da amostra) foi diferente. Os resultados indicam que a diversidade e a riqueza são similares para as duas áreas estudadas. As curvas de rarefação com o índice de Shannon quase atingiram o platô (assíntota). As curvas de acumulação de unidades taxonômicas operacionais (UTOs) também não atingiram a assíntota. O número de Singletons foi maior na floresta secundária em estágio avançado de regeneração e menor na pastagem. A floresta secundária em estágio avançado de regeneração também obteve a maior quantidade de Uniques. A diversidade obtida por caracterização cultural foi similar à obtida por perfis de proteín