Primers development detection of Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum

A semente é um dos principais veículos de introdução de Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum (Xam) nas lavouras de algodão. A bactéria pode estar associada às sementes, tanto externa como internamente, sendo ambas as formas igualmente eficientes na transmissão da doença. A técnica de PCR tem permitido a detecção precoce de patógenos antes mesmo do surgimento dos sintomas na planta, de forma mais rápida, fácil e com um alto nível de sensibilidade, se comparada aos métodos tradicionais, trazendo economia de tempo e dinheiro nos trabalhos de diagnose e identificação. Objetivou-se, com este trabalho, o desenvolvimento de primers específicos para a detecção de Xam em sementes de algodão. Para tanto, primers foram desenhados e testados quanto à especificidade e à sensibilidade em dezenove isolados de Xam pertencentes aos estados de MG, SP, GO, MT e PR, três de X. campestris pv. viticola (Xcv), dois de X. axonopodis pv. phaseoli, X. campestris pv. campestris, um de X. axonopodis pv. vesicatoria, X. axonopodis pv. glycines, Ralstonia solanacearum, Pectobacterium spp., Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis e Curtobacterium flaccumfaciens pv flaccumfaciens. Os primers XMAL970-2F/1R apresentaram resultados positivos para 18 dos 19 isolados de Xam, não amplificando para os demais gêneros e espécies, exceto para o patovar viticola. Embora Xam e Xcv apresentem as mesmas bandas, essas bactérias podem ser diferenciadas pelo hospedeiro, sendo o patovar viticola patogênico a videira. O isolado IBSBF 1733 produziu um fragmento de, aproximadamente, 2000 pb, não característico de Xam. A técnica PCR é capaz de detectar até 10 ng de Xam, quando se emprega o par de primers desenhado XMAL970-2F/1R, permitindo a amplificação de uma banda de, aproximadamente, 903pb.Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, área de concentração em Fitopatologia, para a obtenção do título de Mestre