Biochemical and molecular relations of germination and emergence in rice

No presente trabalho, uma cole????o de ec??tipos de arroz vermelho, com promissoras caracter??sticas fisiol??gicas associadas aos componentes de vigor de sementes, foi utilizada como fonte de trabalho para a execu????o de tr??s trabalhos de pesquisa que visam melhor entender o processo de germina????o/emerg??ncia em arroz. Num primeiro trabalho, foi realizada uma caracteriza????o bioqu??mica e molecular desta cole????o com o objetivo de identificar aqueles que apresentaram melhor potencial de hibridiza????o para a obten????o de popula????es segregantes de mapeamento gen??tico. Num segundo trabalho de pesquisa, um dos genes da α-amilase do arroz, fortemente ligado ao processo de degrada????o das reservas do endosperma durante o processo de germina????o, foi analisado atrav??s de estudos de Seq??enciamento de DNA, para a identifica????o de mutantes para este gene entre os membros da cole????o de ec??tipos de arroz vermelho. Os efeitos das muta????es foram assim, analisados em rela????o ao desempenho fisiol??gico dos ec??tipos. No terceiro trabalho, uma popula????o segregante proveniente do cruzamento entre o ec??tipo de arroz vermelho FFS-45 (com o car??ter germina????o/emerg??ncia em grandes profundidades do solo) e a cultivar BRS 7 taim (sem o car??ter), foi utilizada para a realiza????o de estudos de associa????o de marcadores moleculares ligados ao car??ter, utilizando a t??cnica de an??lise de DNA em bulk. Ao todo, cinco marcadores foram identificados como associados ao car??ter germina????o/emerg??ncia. Os resultados geraram informa????es que contribu??ram para o entendimento do processo fisiol??gico/molecular de germina????o/emerg??ncia em sementes de arroz.In this work, a collection of red rice ecotypes, with promising physiological characteristics associated to seed vigor, was used to conduct three studies to understand the germination/emergence process in rice. In the first study, a biochemical and molecular characterization of the collection was performed to identify the parent s with the best hybrid potential to obtain segregant mapping populations. In the second study, the AMY1 α-amylase gene of rice, involved in the breakdown of endosperm starch during germination, was analyzed by DNA sequencing, to identify mutants to this gene from red rice ecotypes. The mutation effects were analyzed thought physiological performance of ecotypes. In the last study, an segregant population from FFS-45 red rice ecotype (with germination/emergence character) and BRS 7 taim cultivar (without the character), was used to identify molecular markers linked to the trait by DNA Pooling methodology. The molecular markers identified were used to gene prospection in the respective genomics regions. Five SSR markers were identified linked to germination/emergence process. Results of these researches generated a great amount of data that can be contribute to understand the physiological/molecular process involved in rice seed germination/emergence process