Taxonomic and functional profile in subgingival biofilm of generalized aggressive periodontitis patients under maintenance therapy

Orientador: Renato Corrêa Viana Casarin, Mabelle de Freitas MonteiroDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de PiracicabaResumo: O estudo objetivou avaliar o perfil taxonômico e predizer o perfil funcional do biofilme de pacientes com periodontite agressiva generalizada (GAgP) em terapia de manutenção periodontal. Foram avaliados os dados clínicos e microbiológicos de dez pacientes no baseline e pós-tratamento periodontal associado a terapia de suporte (SPT) (5.7±1.3 anos), os quais foram comparados a pacientes periodontalmente saudáveis (n=15). A análise do microbioma subgengival foi realizada pela técnica do sequenciamento do gene 16S rRNA e a predição funcional foi realizada a partir dos dados gerados com o sequenciamento utilizando a ferramenta Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States (PICRUSt2). Clinicamente, SPT promoveu uma redução significativa da profundidade de sondagem, o sangramento à sondagem e o número de bolsas residuais (p<0.05), além disso, não houve perdas dentárias. A análise do microbioma revelou que houve diferenças na ß-diversidade entre o grupo saúde e o grupo GAgP, no baseline e pós-tratamento. Os grupos apresentaram padrões distintos de co-ocorrência, com o grupo GAgP baseline apresentando o maior networking entre espécies. O aumento nas correlações de Streptococcus e uma redução na contribuição de Treponema caracterizou o grupo GAgP SPT que ainda assim apresentou um padrão distinto se comparado a saúde. Funcionalmente, apesar do tratamento periodontal ter reduzido a abundância de genes específicos relacionados à proteína flagelar (K02385) e sensor histidina quinase (K07777), a comparação simultânea do grupo GAgP baseline e tratado com saúde revela a manutenção de alguns genes independente da terapia periodontal. Dessa forma, a longo prazo, o tratamento periodontal promoveu mudanças na composição taxonômica, embora uma persistência de genes no biofilme subgengival de pacientes com GAgP tenha sido observada.Abstract: The study aimed to evaluate the taxonomic profile and predict the biofilm's functional profile in generalized aggressive periodontitis (GAgP) patients undergoing periodontal maintenance therapy. The clinical and microbiological data of ten GAgP patients at baseline and after periodontal treatment (SPT) (5.7 ± 1.3 years of follow-up) were evaluated and compared with data from fifteen periodontally healthy patients. The subgingival microbiome analysis was performed using 16S rRNA gene sequencing, and the functional prediction was performed from the data generated by the sequencing using Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States (PICRUSt2) tool. Clinically, patients on maintenance therapy presented a reduction in probing depth, bleeding on probing, and the number of residual pockets from baseline (p