Characterization of Botrytis cinerea isolates rose of Colombian Andean highlands

ilustraciones, fotografías, gráficas, tablasEl Moho gris causado por Botrytis cinerea es una de las principales enfermedades que afectan al cultivo de rosa en Colombia. Este pa´togeno causa lesiones en diferentes tejidos de la planta, lo que reduce la producción y calidad de las rosas. El manejo de la enfermedad se realiza de manera integrada, considerando prácticas culturales, físicas y un intensivo programa de aplicaciones de fungicidas, no obstante esto no es suficiente para su control. Una de las posibles razones podría ser consecuencia de la diversidad presente en B. cinerea producto de eventos de anastomosis que pueden producirse entre las hifas del hongo y que dan lugar a células multinucleadas y generalmente heterocarióticas y/o a la presencia/ausencia de los elementos genéticos transponibles Boty y Flipper. Hasta el momento existen antecedentes de la caracterización de poblaciones de B. cinerea en diferentes cultivos en el mundo pero no en Rosa sp. en Colombia. Es por ello que el objetivo principal de estudio fue caracterizar fenotípica y genéticamente poblaciones del hongo recuperadas a partir de flores, tallos y hojarasca, procedentes de seis fincas de producción de rosa (cv. Tressor2000) localizadas en la Sabana de Bogotá. Los parámetros fenotípicos evaluados fueron: tipo de micelio, capacidad para formar esclerocios, nivel de esporulación en medio PDA y virulencia sobre pétalos de Rosa sp. La caracterización genética comprendió correspondencia genotípica mediante amplificaciones parciales de los transposones Boty y Flipper y pertenencia de los aislamientos al Grupo I (Botrytis pseudocinerea) y Grupo II (Botrytis cinerea sensu stricto) mediante PCR-RFLP y enzima HhaI. En total se analizaron 270 aislamientos monospóricos (45 por finca y 15 por tipo de tejido). Se encontró una alta variabilidad morfológica aunque esta no estuvo asociada al origen del aislamiento (flor, tallo y hojarasca) pero si con el factor finca. En cuanto a virulencia, se presentaron diferencias significativas (p0,05) por origen de la muestra y por finca, evidenciando que los aislamientos provenientes de tallo son más virulentos que los de flor y hojarasca, y que la virulencia es diferencial por finca. En cuanto a la variabilidad genética, los ensayos de PCR señalan al Grupo II (Botrytis cinerea sensu stricto) como el único presente en la población colombiana. No se detectó el Grupo I (Botrytis pseudocinerea). La variabilidad encontrada en los aislamientos no se encontró asociada con el origen de la muestra pero si con la finca de donde provienen., El genotipo transposa estuvo presente en el 59% de los aislamientos analizados, seguido por boty con el 31% y el 10% por los genotipos vacuma y flipper. Los resultados obtenidos confirman por primera vez en el cultivo de rosas en Colombia la existencia de variabilidad biológica y genotípica de poblaciones de B. cinerea lo cual podría explicar por qué las estrategias de control no otorgan los resultados esperables y señala la necesidad de profundizar más en el conocimiento de éstas con el fin de optimizar el control y con ello obtener una mayor rentabilidad del cultivo de rosa. (Texto tomado de la fuente).Botrytis cinerea (Bc) is the main pathological problem in colombian rose production systems. The damage caused by this pathogen on the petals reduces the marketable product value. Currently, gray mold control is based on an integrated disease management, that includes cultural practices and intensive fungicide program. Nonetheless, the problems associated with this disease have increased over time. Despite the economic impact of gray mold on the Colombian rose production, the knowledge on Bc populations is scarce. The variability in B. cinerea can be the result of hyphae anastomosis that give rise to multinucleated and heterokaryotic cells. Also, the genetic variation could be attributed to the presence of transposable elements (TE) boty/flipper on the Bc fungal genome. There are reports about the genetic characterization of Bc populations in other South American regions, but not on the Colombian rose/B. cinerea pathosystem. The objective of this study was to characterize the biological and genetically variability of the Bc populations recovered from different rose tissue (flowers, stems, and leaf litter) from six rose greenhouses located in three geographical areas of Colombian Andean highlands. Cultivar Tressor 2000 was the object of sampling. The variables evaluated were virulence on rose petals, type of mycelium, sclerotia formation and sporulation in culture medium. The genotypic characterization and Bc group correspondence, was obtained by means of PCR amplification of the boty and flipper TE, and PCR-RFLP of the Bc-hch gene, respectively. 270 single-spore isolates were analyzed. High morphological variability was found but this was not associated with the source of the isolate whether it was flower, stem and leaves. However, this variability was found associated with the greenhouse of origen. Regarding virulence, significant differences (p 0.05) were found and associated with the isolate origin of rose tissue and with the greenhouse. Isolates originated from rose stems are more virulent than from flower and leaves. Virulence was also associated with greeinhouse. All isolates belong to group II (B. cinerea sensu stricto) none of the isolates were B. pseudocinerea. 39% of isolates corresponded to transposa genotype (flipper+/boty+), 31% to boty (flipper-/boty+), 5% to vacuma (flipper-/boty-) and the remaining to flipper (flipper+/boty-). Genotypes could not be differentiated neither by origin of rose tissue nor by greenhouse. This is the first genetic study carried out in Botrytis spp. populations in rose in Colombia.MaestríaMagíster en Ciencias AgrariasFitopatologíaCiencias Agronómica