Hypothetical Protein BPSL3393 of Burkholderia pseudomallei is Involved in Ethanolamine Catabolism

Burkholderia pseudomallei adalah bakterium kediaman tanah yang menyebabkan penyakit muncul secara global yang dikenali sebagai melioidosis. Dianggarkan satu pertiga daripada gen siliko di dalam genom dikelaskan sebagai gen hipotesis. Kumpulan gen ini sukar untuk dicirikan secara fungsional, sebahagiannya disebabkan oleh ketiadaan fenotip yang ketara di bawah tetapan makmal konvensional. Kajian bioinformatik gen hipotetikal menunjukkan gen yang ditetapkan sebagai BPSL3393 yang menguraikan protein kecil 11 kDA dengan domain mengikat CoA. BPSL3393 dipelihara dalam semua genom B. pseudomallei serta pelbagai spesies lain dalam genus Burkholderia. Dengan mengambil kira bahawa CoA memainkan peranan metabolik di mana-mana dalam semua bentuk kehidupan, pencirian BPSL3393 mungkin mendedahkan ciri metabolik B. Pseudomallei yang sebelum ini terlepas pandang. Gen ini dipadamkan dari genom menggunakan pendekatan penggabungan semula homolog berganda yang menghasilkan mutan null. Mutan BPSL3393 tidak menunjukkan perbezaan kadar pertumbuhan dengan jenis yang liar di bawah keadaan pertumbuhan yang kaya dan minima. Ujian fenotip metabolik yang meluas dilakukan dengan melibatkan 95 substrat metabolik. Pemotongan mutan BPSL3393 teruk terjejas dalam metabolisme etanolaminanya. Kadar pertumbuhan mutan itu dilemahkan apabila etanolamina digunakan sebagai sumber karbon tunggal. Analisis transkrip gen metabolisme etanolamina menunjukkan bahawa mereka telah dikawal dalam mutan BPSL3393. Ini seolah-olah menunjukkan bahawa fungsi BPSL3393 sebagai pengawal selia positif untuk metabolisme etanolamina