Identification d'ARN régulateurs bactériens (approches Bioinformatiques et Expérimentales)

Les ARN régulateurs permettent aux bactéries de moduler l'expression de gènes cibles au niveau post-transcriptionnel afin de s'adapter aux variations de leur environnement. L'objectif de ce travail de thèse est de mettre au point un logiciel (Intergenic Sequence Inspector, ISI) capable de prédire l'existence d'ARN régulateurs dans un génome bactérien. ISI a été employé pour analyser le génome d'Escherichia coli puis l'étude de son transcriptome, nous permet d'identifier 78 ARN régulateurs connus et 29 candidats putatifs ce qui démontre l'efficacité d'ISI. Le génome de la bactérie Staphylococcus aureus est analysé de la même manière, nous conduisant à l'identification et à la vérification expérimentale d'au moins douze ARN régulateurs exprimés in vivo dont sept localisés dans les îlots de pathogénicités. Notre étude montre qu'il existe des variations significative d'expression de ces ARN régulateurs en fonction des souches étudiées suggérant leur implication dans la régulation de la virulence bactérienne.RENNES1-BU Sciences Philo (352382102) / SudocSudocFranceF