Approche éco-génomique de la biodiversité (phylogéographie comparée des cyprinidés européens et analyse spatio-temporelle des processus introgressifs entre deux espèces de chondrostomes)

Un peuplement n'est pas une entité figée et stable, mais une communauté en perpétuel renouvellement désormais soumis à l'action directe de l'homme. La phylogéographie permet de décrire et d'expliquer la répartition géographique des taxa. Bien que chaque espèce présente une histoire qui lui est propre, l'augmentation du nombre d'études a permis l'émergence de certains processus qui tendent à se généraliser. Nous avons pu mettre en évidence certains biais, indispensables à résoudre avant toute tentative de phylogéographie comparée. Chez les Teleostei en général et les Cyprinidae en particulier, les phénomènes d'hybridations sont fréquents. Suite à la vision géographique de la spéciation, abordée par l'approche phylogéographique, nous nous sommes intéressés aux mécanismes de la spéciation par l'étude de la zone hybride entre deux espèces de Chondrostomes. Celle-ci caractérisée par une hybridation introgressive bi-directionnelle suit le modèle des Nouveautés Evolutives (Arnold 1997), en combinant la présence de combinaisons génomiques environnement-indépendantes et environnement-dépendantes. Nous avons pu montrer l'importance de combiner les approches moléculaire et morphologique dans le décryptage des processus d'hybridation en permettant d'aborder les relations génome-environnement. Les phénomènes d'introgression conduisent à un débat encore délicat concernant le statut de protection des différentes entités participant à de tels processus. Cette approche éco-génomique réalisée tant au niveau populationnel que spécifique illustre la complexité des interactions existant entre gènes et milieuxAIX-MARSEILLE1-BU Sci.St Charles (130552104) / SudocSudocFranceF