Contribution à la caractérisation d'un îlot génomique spécifique d'une souche de BRUCELLA PINNIPEDIAE isolée de mammifères marins

La brucellose est une anthropozoonose mondiale dont l'agent étiologique est une bactérie du genre Brucella, coccobacille pouvant infecter de multiples espèces de mammifères terrestres. En 1994, pour la première fois, l'isolement de Brucella, atteignant des mammifères marins, a permis de les classer en deux espèces qui sont Brucella pinnipediae et Brucella cetaceae. C'est en 2001 que les premiers cas mondiaux d'infections humaines causées par une souche de brucella atteignant des mammifères marins ont été recensés. Ces deux cas décrits chez l'homme, correspondent à une brucellose aiguë grave (neurobrucellose et granulome intracérébral) qui a nécessité une antibiothérapie lourde. La souche incriminée et déterminée comme étant une espèce appartenant à l'espèce B. pinnipediae, porterait-elle des éléments génétiques de virulence particuliers ? L'objectif général de ce travail s'inscrit dans l'étude de gènes pouvant appartenir à un îlot génomique ayant une potentialité de virulence. L'analyse génétique antérieure de B. pinnipediae a permis d'isoler un fragment de 319 pb spécifique de la souche. Ce fragment a ensuite été utilisé en tant que sonde pour séquencer une zone plus large dans laquelle il y avait quatre ORFs représentant une taille de 5,9 kb. Notre travail a consisté à montrer que ce fragment de 5,9 kb pouvait appartenir à un îlot génomique en criblant une banque génomique de B. pinnipediae, par l'intermédiaire de deux sondes stratégiquement sélectionnées en amont et en aval du fragment de 5,9kb. Ainsi, deux nouveaux segments ont été mis en évidence un de 5kb, l'autre de 18kb . Seul le fragment le plus court a pu être séquencé, révélant quatre gènes dont deux identiques au fragment de 5,9kb. Les deux autres ORF codent ainsi pour un élément de la famille des transposases (IS3) possédant une forte identité de séquence avec d'autres bactéries du genre Brucella.TOURS-BU Sciences Pharmacie (372612104) / SudocSudocFranceF