Dynamique des légionelles dans un fleuve côtier méditerranéen, le Tech.

Plus d un quart de siècle après leur découverte, les légionelles constituent toujours un problème de santé publique et suscitent un grand intérêt au sein de la communauté scientifique. Le comportement de cette bactérie hydrotellurique dans son environnement naturel est aujourd hui méconnu. L objectif de ce travail a été d apporter les premiers éléments pour mieux comprendre l écologie complexe des légionelles notamment en déterminant les facteurs responsables de leur occurrence et de leur persistance en milieu fluviatile. Les difficultés inhérentes à la détection des légionelles par les techniques classiques de mise en culture ont nécessité le développement de méthodes alternatives adaptées au dénombrement des Legionella pneumophila dans les eaux de surface et à l analyse de la diversité génétique des Legionella spp.. Les travaux réalisés ont permis le développement d une méthode rapide et directe d immunodétection des L. pneumophila combinée à la cytométrie en phase solide et couplée au marquage de l activité estérase des cellules, afin de quantifier les cellules viables potentiellement pathogènes dans les eaux et les sédiments fluviatiles. La méthode d empreinte moléculaire, de CE-SSCP1, développée dans ce travail, a permis d étudier l évolution au cours d un cycle annuel de la structure génétique des populations de légionelles présentes en rivière. Les résultats de cette étude réalisée sur un fleuve côtier méditerranéen, le Tech, ont permis de confirmer le caractère ubiquitaire des légionelles, présentes en quantité importante et récurrente de l amont à l aval du fleuve. L étude de la dynamique des L. pneumophila a mis en évidence (i) des variations spatiales des concentrations en L. pneumophila dans les eaux fluviales, (ii) l existence d un gradient de concentration de l amont vers l aval, et (iii) des variations saisonnières, avec des maxima en été et des minima en hiver. L étude de la diversité génétique des légionelles a montré des évolutions différentes et notamment une composition génétique très diversifiée des populations légionelles dès l amont du fleuve et une absence de gradient amont/aval des espèces présentes. Par ailleurs, l impact des rejets anthropiques sur l activité physiologique des L. pneumophila et sur la structure génétique des populations de légionelles a été démontré, et principalement ceux des rejets des établissements thermaux utilisant des eaux chaudes. La température a été estimée comme étant un des facteurs abiotiques clés dans la prolifération et la survie des légionelles en rivière. 1 CE-SSCP : Capillary Electrophoresis Single Strand Conformation PolymorphismPARIS-BIUSJ-Physique recherche (751052113) / SudocSudocFranceF