Mise au point d'une méthode de PCR en temps réel pour la détection d'Acanthamoeba spp. dans les ulcères cornéens

Les amibes libres du genre Acanthamoeba spp. sont étudiées depuis le début du XXème siècle. Elles peuvent être responsables de kératites, pathologie oculaire grave de l'immunocompétent pouvant évoluer vers la cécité et dont le facteur de risque principal est le port de lentilles de contact. Peu de molécules sont efficaces et il peut exister des présentations cliniques atypiques plus difficiles à diagnostiquer. Toutes ces données montrent la nécessité de développer des outils de diagnostic biologique sensibles et spécifiques. Dans une première partie, nous avons mis au point une méthode de PCR en temps réel en SYBRGreen pour la détection d'Acanthamoeba spp. dans les ulcères cornéens en ciblant une région de l'ARNr18S. Elle permet de mettre en évidence le génotype T4 responsable des atteintes oculaires dans plus de 95% des cas. Dans une deuxième partie, l'étude clinique réalisée sur 101 prélèvements retrouve 10,9% de positifs en PCR contre 1% de positifs en culture soit une sensibilité 10 fois plus importante. De plus, la mise en évidence d'Acanthamoeba spp. par PCR permet un rendu de résultat plus rapide au clinicien pour le conforter dans un diagnostic et/ou un traitement.LYON1-BU Santé (693882101) / SudocCLERMONT FD-BCIU-Santé (631132104) / SudocSudocFranceF