Caractérisation des populations de Mycosphaerella fijiensis et épidémiologie de la cercosporiose noire du bananier dans la région de Kisangani, RDC

The black leaf streak disease (MNR) , caused by the ascomycete fungus Mycosphaerella fijiensis , is one of the most devastating diseases banana ( Musa spp.) . It is a major constraint to production , particularly in countries of the humid tropics where banana is a staple food crop . The objective of this thesis was to characterize the M. fijiensis populations and to study the epidemiology of the MNR in region of Kisangani (DRC) to evaluate protection strategies integrated to develop in crops of bananas and plantains . The particularity of our approach lies in the combination of studies laboratory , according to classical and molecular approaches , and field experiments to better understand the characteristics epidemiology of the disease according to the seasons and cropping systems . Phenotypic characteristics of strains isolated from Kisangani on PDA medium were typical of the species M. fijiensis . This identification was confirmed by an approach based on the molecular sequence of a part of the ribosomal DNA ITS regions including ( internal transcribed spacers ) and 5.8 gene S. The existence of two types of cross -1 and Mat1 Ma1 -2 in the population has been disclosed but an imbalance between the two euhedral was noticed . The evaluation of the pathogenicity of strains showed that all strains tested pathogenicity vis-à -vis the Cavendish cultivar ' Grand Nain '. Our study also to highlight the differences in virulence between strains . Tests sensitivity to fungicides showed that strains of the DRC sensitive to triazoles and carbendazim , but some strains are resistant to azoxystrobin . Epidemiologically , our study showed that the two forms fungal (anamorph and teleomorph ) are present not only in rainy season but also subsèche season . They therefore play a important role in the epidemiology of the disease. The incidence of the disease was slightly lower seasonal subsèche in wet season. a comparison of disease progression in both seasons by culture system revealed that the development of the MNR was more slow secondary forest in fallow and garden box and the incidence and severity was greater on plantains on bananas. the better tolerance cultivar Yangambi Km5 was confirmed. These findings shed new light on the epidemiology of disease in the region of Kisangani and the characteristics of the population involved. They have been exploited to develop a list of recommendations to better manage the damage of M. fijiensis , a significant pathogen evolutionary potential . Google Traduction pour les entreprises :Google Kit du traducteurGadgetLa maladie des raies noires (MRN), causée par le champignon ascomycète Mycosphaerella fijiensis, est l'une des maladies les plus dévastatrices du bananier (Musa spp.). Elle constitue une contrainte majeure à sa production, particulièrement dans les pays des tropiques humides où le bananier est une culture alimentaire de base. L'objectif de cette thèse a été de caractériser les populations de M. fijiensis et d'étudier l'épidémiologie de la MRN dans la région de Kisangani (RDC) en vue d'évaluer les stratégies de protection intégrée à développer dans les cultures de bananiers et bananiers plantains. La particularité de notre approche réside en la combinaison d'études en laboratoire, selon des approches classique et moléculaire, et des expérimentations sur le terrain pour mieux connaître les caractéristiques épidémiologiques de la maladie selon les saisons et les systèmes de cultures. Les caractéristiques phénotypiques des souches isolées de Kisangani sur milieu PDA étaient typiques de l'espèce M. fijiensis. Cette identification a été confirmée selon une approche moléculaire sur base du séquençage d'une partie de l'ADN ribosomal incluant les régions ITS (internal transcribed spacers) et le gène 5,8S. L'existence des deux types de croisement Mat1-1 et Ma1-2 au sein de la population a été révélée mais un déséquilibre entre les deux idiomorphes a été remarqué. L'évaluation de la pathogénicité des souches a montré que toutes les souches testées ont un pouvoir pathogène vis-à-vis du cultivar Cavendish " Grande Naine ". Notre étude a aussi permis de ressortir des différences de virulence selon les souches. Les tests de sensibilité aux fongicides ont montré que les souches de la RDC sont sensibles aux triazoles et au carbendazime, mais certaines souches seraient résistantes à l'azoxystrobine. Sur le plan épidémiologique, notre étude a révélé que les deux formes fongiques (anamorphe et téléomorphe) sont présentes non seulement en saison des pluies mais également en saison subsèche. Elles jouent donc un rôle important dans l'épidémiologie de la maladie. L'incidence de la maladie 6 Résumé a été légèrement moindre en saison subsèche qu'en saison humide. Une comparaison de la progression de la maladie pendant les deux saisons selon le système de culture a révélé que le développement de la MRN a été plus lent en forêt secondaire qu'en jachère et en jardin de case et l'incidence et la sévérité ont été plus grandes sur les plantains que sur les bananes. La meilleure tolérance du cultivar Yangambi Km5 a été confirmée. Ces résultats ont apporté des éléments nouveaux sur l'épidémiologie de la maladie dans la région de Kisangani et sur les caractéristiques de la population en présence. Ils ont été exploités pour établir une liste de recommandations visant à mieux gérer les dégâts de M. fijiensis, un pathogène au potentiel évolutif important