AFLP assessment of genetic variability in cassava accessions (Manihot esculenta) resistant and susceptible to the cassava bacterial blight (CBB)

La bactériose du manioc est causée par #Xanthomonas axonopodis$ pv. #manihotis$ (#Xam$). La résistance observée chez #Manihot esculenta$ a été introduite à partir de l'espèce sauvage #M. glaziovii$. Elle est supposée polygénique et héritée de manière additive. Quatre-vingt-treize variétés de #M. esculenta$ (Crantz) ont été évaluées à la fois par la technique AFLP et pour leur résistance/sensibilité à la bactériose. L'analyse AFLP a été faite avec deux combinaisons d'amorces primers et montre un taux de polymorphisme de 79.2%. Le phénogramme obtenu montre entre 74% et 96% de similarité entre les variétés analysées. L'analyse permet l'identification de chaque variété montrant ainsi qu'il n'y a pas de duplicat au sein de l'échantillon utilisé. Deux souches de #Xam$ ont été utilisées pour l'évaluation de la résistance. On observe une variabilité dans la réaction des variétés aux deux souches de #Xam$. La corrélation de la résistance à #Xam$ indique un coefficient de 0.53, suggérant que la résistance à chaque souche de #Xam$ est indépendante. Une analyse de correspondance multiple met en évidence une distribution au hasard de la réaction résistance/sensibilité par rapport à la diversité génétique évaluée par AFLP. Un index total d'hétérozygotie est calculé afin de déterminer la diversité aussi bien entre les groupes qu'au sein des groupes obtenus. Nos résultats montrent que la résistance est largement distribuée au sein des variétés de manioc et que l'AFLP est une méthode efficace et performante qui permet une évaluation quantitative de la similarité entre les variétés de manioc. (Résumé d'auteur