Levantamento de Begomovirus e Crinivirus em cultivos de batata e tomate no Estado do Paraná, Brasil

Orientador: Prof. Dr. Henrique da Silva Silveira DuarteCoorientadora: Profa. Dra. Renata Faier CalegarioDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de CIências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Agronomia - Produção Vegetal. Defesa : Curitiba, 28/05/2020Inclui referências: p. 42-48Área de concentração: Produção VegetalResumo: Nas últimas décadas, a alta incidência de vírus transmitidos por moscabranca tem sido um problema nos campos de tomate, ameaçando, mais recentemente, a cultura da batata. Um levantamento para estudar a ocorrência de Begomovirus e Crinivirus em campos de produção de tomate e batata foi conduzido de 2015 a 2018 em onze municípios do Estado do Paraná, Brasil. Amostras foliares foram coletadas em campos de Araucária, Campo do Tenente, Campo Largo, Castro, Contenda, Lapa, Faxinal, Morretes, Reserva, Palmeira e São Mateus do Sul. Amostras de mosca-branca foram coletadas em campos de tomate e batata para identificar a espécie predominante e investigar a presença de ambos os vírus no vetor. DNA e RNA totais foram extraídos das folhas e do vetor e foram testados por PCR e RT-PCR para detectar begomovírus e crinivírus, respectivamente, e por PCR para amplificar a região mtCOI do vetor. Os respectivos amplicons foram sequenciados para identificação do vírus e da mosca-branca e para realizar análises filogenéticas. Os resultados revelaram que das 215 plantas de tomate testadas, apenas 14 estavam infectadas por crinivírus, o que corresponde a 6,5% do total de amostras. Todas as amostras de tomate, batata e mosca-branca analisadas por PCR apresentaram reação negativa para begomovírus e as amostras de batata e mosca branca analisadas por RT-PCR também testaram negativo para crinivírus. No entanto, o ToCV foi detectado em uma amostra de mosca-branca coletada em tomateiro no município da Lapa. As análises filogenéticas revelaram que os isolados de crinivírus detectados em tomates e no vetor formaram um grupo monofilético com isolados de ToCV do Brasil e as populações de mosca-branca coletadas em ambas as culturas eram Bemisia tabaci Middle East-Asia Minor - MEAM 1. Esses resultados indicam uma baixa ocorrência de begomovírus e crinivírus que infectou lavouras de batata e tomate cultivadas no Paraná durante o período da pesquisa. Palavras-chave: Bemisia tabaci. Tomato chlorosis virus. Tomato severe rugose virus .Abstract: In the last decades, the high incidence of viruses transmitted by whiteflies has been a problem in the tomato fields, threatening, more recently, the potato crops. A survey of Begomovirus and Crinivirus was conducted on cultivated tomatoes and potatoes plants from 2015 to 2018 to study their occurrence at eleven municipalities of the Parana state, Brazil. Leaf samples were collected in fields from Araucária, Campo do Tenente, Campo Largo, Castro, Contenda, Lapa, Faxinal, Morretes, Reserva, Palmeira and São Mateus do Sul. Whiteflies samples were collected in tomato and potato fields to identify the predominant specie and to investigate the presence of both viruses in the vector. Total DNA and RNA was extracted from the leaves and the vector and tested by PCR and RT-PCR to detect begomoviruses and the crinivirus, respectively, and by PCR to amplify the mtCOI region of the vector. Respectives amplicons were directly sequenced for virus and the whitefly identification and to perform phylogenetic analysis. The results revealed that of the 215 tomatoes plants tested, just 14 were infected by the virus which corresponds to 6.5% of the total analyzed samples. All PCR-analyzed samples of tomatoes, potatoes and whiteflies proved negative for begomoviruses and the RT-PCR of all samples of potatoes and whiteflies also proved negative for crinivirus. However, ToCV was detected in a whitefly sample collected in tomato field at the municipality from Lapa. The phylogenetic analysis revealed that the isolates of criniviruses detected in tomatoes and the vector form a monophyletic group with ToCV isolates from Brazil and all populations collected in both crops was Bemisia tabaci Middle East-Asia Minor - MEAM 1. These results indicate a low occurrence of begomovirus and crinivirus infecting cultivated potatoes and tomatoes crops in Paraná State during the survey period. Keywords: Bemisia tabaci. Tomato chlorosis virus. Tomato severe rugose viru