Analyse épidémio-génétique de la fonction rénale chez les personnes d’Afrique sub-Saharienne vivant avec le VIH

Nearly 500 million people worldwide suffer from chronic kidney disease (CKD) and about 80% of them live in low- and middle-income countries. Paeople living with HIV (PLHIV) are at increased risk of renal disease, particularly in sub-Saharan Africa. This situation is probably related to genetic susceptibility conferred by variants of the apolipoprotein L1 gene (APOL1). These variant highly prevalent in Africa, and particularly in West Africa, have been identified as being strongly implicated in the occurrence of serious renal diseases experienced by PLHIV.The aim of this thesis was to provide data about the long-term evolution of renal function in sub-Saharan African PLHIV treated for HIV infection and assess the risk of kidney complications associated with APOL1. We analyzed the medical and genetic data of several cohorts of PLHIV followed in different health care facilities in West and Central Africa.The prevalence and incidence of CKD in the different cohorts and estimated according to the recommendations of the Kidney Disease Outcomes Quality Initiative are low to moderate and contrast with the observations made in some countries of the region with prevalence reaching 30%.The frequencies of the 2 risk variants of the APOL1 gene are also lower than expected, with only 3 to 5% of carriers of the high-risk genotype. The observation of higher frequencies in West Africa than in Central Africa is, however, confirmed.Due to the low number of carriers of the high-risk genotype and the low prevalence of CKD, we were unable to demonstrate a significant effect of APOL1 variants on the risk of kidney complications.However, our work confirms the role of other risk factors such as age, immunosuppression, hypertension and Tenofovir Disoproxil Fumarate exposure. These observations led us to evaluate the performance of a prediction score of CKD initially developed for Western PLHIV. We show that this score can be used in sub-Saharan Africa to identify people at risk of developing a CKD and provide them with targeted monitoring and prevention intervention.These findings provide reassuring information about the evolution of renal function in West African PLHIV followed and treated for their HIV infection. However, given that management of severe kidney disease is a major challenge is these settings, the implementation of screening and prevention strategies must be a public health priority.Près de 500 millions de personnes dans le monde souffrent de maladies rénales chroniques (MRC) et environ 80% d’entre eux résident dans des pays à revenu faible ou intermédiaire. Les personnes vivant avec le VIH (PVVIH) sont exposées à un risque rénal accru en particulier en Afrique sub-Saharienne. Cette situation est probablement liée à une susceptibilité génétique conférée par des variants du gène de l’apolipoprotéine L1 (APOL1). Ces variants, dont la fréquence est élevée en Afrique et en particulier en Afrique de l’Ouest, ont été identifiés comme fortement impliqués dans la survenue de pathologies rénales graves rencontrées chez les PVVIH.Ce travail de thèse avait pour objectif d’améliorer les connaissances sur l’évolution à long terme de la fonction rénale chez des PVVIH d’Afrique subsaharienne traités contre l’infection à VIH et sur le risque de complications rénales associé aux variants génétiques de APOL1. Nous avons analysé les données médicales et génétiques de plusieurs cohortes de PVVIH suivies dans différentes structures sanitaires d’Afrique de l’Ouest et du Centre.Les prévalences et incidences de la MRC observées dans les différentes cohortes et estimées selon les recommandations du Kidney Disease Outcomes Quality Initiative sont faibles à modérées et contrastent avec les observations faites dans certains pays de la région avec des prévalences atteignant 30%.Les fréquences des 2 variants à risque du gène APOL1 sont également plus faibles qu’attendues, avec seulement 3 à 5% de porteurs du génotype à haut risque. L’observation de fréquences plus élevées en Afrique de l’Ouest qu’en Afrique Centrale est cependant confirmée.En raison du faible nombre de porteurs du génotype à haut risque et des faibles prévalences de MRC, nous n’avons pas pu mettre en évidence un effet significatif des variants de APOL1 sur le risque de complications rénales.En revanche, nos travaux confirment le rôle des facteurs de risque connus tels que l’âge, l’immunodépression, l’hypertension artérielle et l’exposition au Ténofovir Disoproxil Fumarate. Et ces observations nous ont conduits à évaluer les performances d’un score prédictif de la MRC initialement développé pour les PVVIH occidentaux. Nous montrons qu’il peut être utilisé en Afrique sub-saharienne pour identifier les personnes à risque de développer une MRC et leur proposer un suivi et une prise en charge adaptés.Ces travaux apportent des éléments rassurants quant à la santé rénale des PVVIH d’Afrique de l’Ouest suivis et traités pour leur infection VIH. Cependant, au regard des difficultés de prise en charge des maladies rénales sévères, la mise en place de stratégies de dépistage et de prévention doit constituer une priorité de santé publique