Analysis of genetic variability of half highbush and highbush blueberries (Vaccinium L.) cultivars using SSR method

Šio darbo tyrimo tikslas - atlikti 19 aukštaūgių ir 5 pusiau aukštaūgių šilauogių veislių, surinktų Vytayto Didžiojo universiteto Kauno Botanikos sode, genetinę analizę panaudojant SSR metodą.Genetiniams tyrimams buvo panaudoti jauni šilauogių lapeliai, kurie buvo surinkti 2011 m. rugsėjo mėn. Vilniaus universiteto botanikos sode, bei 2011 m. gegužės mėn. Vytauto Didžiojo universiteto Kauno botanikos sode. Iš šilauogių jaunų lapelių išskyrėme DNR silikagelio kolonėlėmis. Šilauogių tyrimams naudojome 30 mikrosatelitinius pradmenis, kurie sukurti Boches ir kt. mokslininkų (2005). Vykdėme vertikalią elektroforezę poliakrilamidiniame gelyje. Patikrinus trisdešimties pradmenų tinkamumą šilauogių molekuliniams tyrimams iš jų atrinkome ir pritaikėme aštuonis mikrosatelitinius pradmenis CA23F, NA961, NA1040, CA421F, CA169F, CA112F, VCC_J9, VCC_S10. Atlikus molekulinę analizę, bendras fragmentų skaičius šilauogėse svyravo nuo 7 iki 31, o dydis - nuo 115 iki 300 bp. Analizuojant unikalių alelių pasireiškimą veislėse, daugiausiai unikalių alelių aptikta ‘Dixi’ ir ‘Sila’ veislėse, mažiausiai – po vieną unikalų alelį, buvo aptikta ‘Croatan’ ir ‘Blueheaven’ šilauogių veislėse.The aim of this study was analysis 19 highbush and 5 half highbush blueberries cultivars collected Vytautas Magnus University, Kaunas Botanical Garden, genetic analysis using the SSR method. For blueberries genetic analysis were used young blueberry leaves, which were collected in Vytautas Magnus University Kaunas Botanical Garden at May 2011, and in Vilnius University Botanical Garden at September 2011. The DNA was extracted of young blueberry leaves with a DNA-silica columns. For blueberries research used 30 microsatellite primers designed by Boches et al. (2005). Fragments were visualized in a vertical poliacrilamid gel electrophoresis. Were checked thirty primers for blueberries. For analysis 8 microsatellite primers were selected : CA23F, NA961, NA1040, CA421F, CA169F, CA112F, VCC_J9, VCC_S10. The total number of fragments was ranged from 7 to 31, and the size - from 115 to 300 bp. The most unique alleles were detected in 'Dixi' and 'Sila' species, at least - one unique allele was found in 'Croatan' and 'Blueheaven' cultivars.Vytauto Didžiojo universiteta