Characterization of Lithuanian Hound Mitochondrial DNA using Control Region and Cytochrome b markers

Lietuvių skalikai – tai medžioklinė šunų veislė, turinti mažą skaičių individų. Mitochondrinės DNR kontrolinis regionas ir citochromas b naudoti kaip įrankiai, padedantys nustatyti 29-inių Lietuvių skalikų genetinę įvairovę veislės viduje bei įvertinimui Lietuvių skalikų ir kitų 59-ių šunų veislių tarpveislinę genetinę įvairovę. Tyrimui naudoti burnos epitelio ląstelių mėginiai (60), surinkti Pakruojyje, Lietuvoje, 2017 metais. MtDNR kontrolinio regiono amplifikacijai buvo naudoti pradmenys R51 (5’-TATGTTTATGGAGTCGTGCGA-3’), F15406 (5 ’TTTGCTCCACCATCAGCACC-3’), citochromo b amplifikacijai mitL68 (5‘CTTACTACACAA TCAAGGATAT-3‘), mitH67 (5‘TTACTCTCCATTTTTGGTTTAC-3‘). Įvertinus citochromo b sekoskaitos rezultatus MEGA 6 programa, galima daryti prielaidą, jog tirti Lietuvių skalikų veislės šunys pagal cytb haplotipus pasiskirsto į tris grupes (A, B, C). Išanalizavus lietuvių skalikų kontrolinio regiono ‘3 srities seką, nustatytos 7 nukleotidų pozicijos, kuriose įvykusi vienos bazės pakaitos mutacija. Išanalizavus lietuvių skalikų kontrolinio regiono 5‘ srities seką, nustatyta 21 nukleotidų pozicijų, kuriose įvykusi vienos bazės pakaitos mutacija. Pagal mtDNR kontrolinio regiono ‘5 žymenis, gauti rezultatai nurodo, jog tirti Lietuvių skalikų veislės šunys išsiskiria į 8 grupes. Palyginus lietuvių skalikų sekas su 57 kitų veislių sekomis nustatyta, kad A kilmės linijos skalikai grupuojasi su rotveileriais ir bigliais (cyt b), o D kilmės linijos šunys yra vienoje grupėje su seniausių Šv. Huberto skalikų tiesioginiais palikuoniais – Baseto skalikais; pagal kontrolinio regiono 5’ sritį D kilmės linijos šunys grupuojasi ir su bigliais. Iš gautų rezultatų galima daryti prielaidą, kad D kilmės linijai priklausantys skalikai yra senovinių lietuvių skalikų palikuonys, o A kilmės linijos skalikų genetinė struktūra galėjo susiformuoti XX a. pabaigoje.Lithuanian Hounds are a hunting dog breed with a small number of individuals. Mitochondrial DNA control region and cytochrome b were used as tools to determine the genetic diversity of 29 Lithuanian hounds and to compare with 59 other breeds of dogs. Oral epithelial cell samples (60) collected in Pakruojis, Lithuania, in 2017 years. For control region was used R51 (5'TAT GTTTATGGAGTCGTGCGA-3‘), F15406 (5‘TTTGCTCCACCACCA TCAGCACC-3’) primers, for cytochrome b – mitL68 (5’CTTACTACACAATCAAGGATA T-3’), mitH67 (5’TTACTCTCC ATTTTTGGTTTAC-3’). After evaluating the results of cytochrome b sequencing with MEGA 6 program, it can be assumed that the studied Lithuanian Hound breed dogs are divided into three groups (A, B, C) according to cytb haplotypes. After analyzing the sequence of the region 3 of the control region of Lithuanian hounds, 7 nucleotide positions were identified, in which a mutation of one base substitution occurred. After analyzing the sequence of the 5 'region of the control region of Lithuanian hounds, 21 nucleotide positions with one base substitution mutation were identified. According to the '5 markers of the mtDNA control region, the obtained results indicate that the studied Lithuanian Hound breed dogs are divided into 8 groups. Comparing the sequences of Lithuanian hounds with the sequences of 57 other breeds, it was found that hounds of A group are grouped with rottweilers and beagles (cyt b), and dogs of D group are in the same group with the oldest St. Hubert Hounds - the Basset Hounds. From the obtained results it can be assumed that hounds belonging to the D group are descendants of ancient Lithuanian hounds, and the genetic structure of the A hounds could have formed in the 20th century.Gamtos mokslų fakultetasBiologijos katedr