Analysis of infections/fungal colonisations occurences in hospitalized patients in Specialist Hospital in 2012

Na przestrzeni ostatnich lat stwierdzono znaczny wzrost szpitalnych zakażeń grzybiczych. Do najważniejszych czynników etiologicznych zalicza się grzyby drożdżopodobne z rodzaju Candida oraz grzyby pleśniowe z rodzaju Aspergillus. Pacjentami szczególnie narażonymi na zakażenia są chorzy przebywający w Oddziałach Intensywnej Terapii. Celem pracy była analiza epidemiologiczna zakażeń grzybiczych u pacjentów hospitalizowanych w Szpitalu Specjalistycznym oraz analiza genotypowa szczepów C. glabrata pochodzących od pacjentów OAiIT. Analizie epidemiologicznej poddano wyniki badań mikologicznych z trzechoddziałów Szpitala Specjalistycznego z 2012 roku. Materiał do analizy genetycznej stanowiło 11 szczepów C. glabrata izolowanych z aspiratów oskrzelowo-tchawiczych pobranych od pacjentów OAiIT. Analizę przeprowadzono z zastosowaniem metody RAPD-PCR z użyciem 5 starterów: CD 16AS, HP 1247, ERIC-2, OPE-3 oraz OPE-18. Materiał genetyczny izolowano przy pomocy zestawu Genomic Mini AX YEAST. Gatunek C. albicans był najczęściej izolowanym patogenem od pacjentów oddziałów Anestezjologii i Intensywnej Terapii oraz Leczenia Oparzeń i Chirurgii Plastycznej. Za zakażenia grzybicze pacjentów Oddziału Chirurgii Czaszkowo-Szczękowo-Twarzowej, Onkologicznej i Rekonstrukcyjnej najczęściej odpowiedzialny był gatunek C. krusei. Odsetek aspiratów oskrzelowo–tchawicznych pobranych od pacjentów OAiIT, z których izolowano grzyby w stężeniu patologicznie znamiennym ≥106 CFU/ml, stanowił 8%. Analiza genetyczna wykazała duże zróżnicowanie wśród badanych szczepów C. glabrata. Nie stwierdzono ani jednej pary szczepów o 100% homologii. Największą siłę różnicującą charakteryzowały się startery OPE-3 oraz OPE-18. Uzyskane wyniki pozwalają wysnuć wnioski co do endogennego źródła zakażeń.In recent years, number of invasive fungal infections (IFI) has significantly increased. The most common causes are Candida spp. and Aspergillus spp. Patients remaining in Intensive Care Units (ICU) are especially exposed to nosocomial fungal infections. The aim of this study was epidemiological analysis of fungal infections in patients hospitalized in Specialist Hospital and molecular genotyping of C. glabrata strains obtained from ICU patients. Test results that were obtained from three Hospital Departments in the 2012 were subject to epidemiological analysis. The experimental material were 11 C. glabrata strains isolated from tracheal aspirate fluid obtained from ICU patients. For molecular analysis RAPD-PCR method with 5 primers was used: CD 16AS, HP 1247, ERIC-2, OPE-3 and OPE-18. The genetic material was isolated according to Genomic Mini AX YEAST kit. C. albicans was most frequently isolated from patients remaining in Intensive Care Unit and Burn Treatment and Plastic Surgery Unit. C. krusei was the most frequent cause of fungal infections in patients hospitalized in Cranio-maxillofacial Surgery, Oncology and Reconstructive Unit. The percentage of tracheal aspirate fluid obtained from ICU patients, from which fungi were isolated in pathognomonic significant concentration, was 8%. Molecular genotyping indicated a wide spectrum of genetic diversity of analyzed strains of C. glabrata. There were no two identical strains that showed 100% homology. Primers OPE-3 and OPE-18 showed the highest discriminatory power. These results enable us to draw conclusions about endogenous source of IFI