Molecular analysis of simple and complex genetic variants in a cohort of patients with hemophilia A : mechanisms and diagnostic implications

Haemophilia A (HA) is caused by widespread mutations in the factor VIII gene. Although genetic alterations responsible for HA can now be identified in a vast majority of patients, molecular diagnostic remains challenging in some patients. This thesis addresses important issues in the diagnostic and molecular mechanisms of some frequent or rare genetic alterations associated with HA. It demonstrates the value of computational and molecular approaches for predicting the causality of unreported missense mutations. It also shows that the overrepresentation of specific missense mutations in mild HA can be explained by a founder effect rather than by an independent occurrence. Also, it highlights how complex genetic rearrangements such as tandem inversion duplication within intron 1 and exons 1-22 duplications involving intron 22 homologous repeats (int22h) can be detected and their occurrence best explained. Finally, it demonstrates for the first time the existence of wild-type human genotype harbouring five int22h copies identified in the rare intron22 inversion type 3 of the factor VIII gene.L'hémophilie A (HA) est due à des mutations du gène F8 codant pour le facteur VIII de la coagulation. Bien que les mutations génétiques responsables de l'HA puissent désormais être identifiées pour la majorité des patients, le diagnostic moléculaire reste problématique chez certains sujets atteints. Cette thèse aborde les techniques d’identification et d’interprétation de plusieurs défauts génétiques concernant quelques nucléotides ou incluant de larges remaniements. Elle propose des stratégies bio-informatiques et moléculaires pour évaluer la causalité de mutations ponctuelles nouvellement décrites. Elle montre également que la surreprésentation des quelques mutations faux-sens peut être expliquée par un effet fondateur, plutôt que par un événement de novo récurrent. Ensuite, elle suggère des hypothèses pour expliquer les mécanismes moléculaires de certains réarrangements génétiques complexes tels qu’une duplication en miroir pour la duplication de l’exon 1 et une participation de deux séquences homologues int22h pour la duplication des exons 1 à 22. Finalement, elle montre pour la première fois qu’il existe des génotypes humains normaux contenant cinq copies de séquences homologues int22h qui sont techniquement visibles dans un type rare de l’inversion de l’intron 22.(BIFA - Sciences biomédicales et pharmaceutiques) -- UCL, 201