Polymorphismes biologiques et moléculaires chez le complexe d'espèces Nacobbus aberrans (Thorne, 1935) Thorne & Allen, 1944 (Nematoda: Pratylenchidae)

Diplôme : Dr. d'UniversiteOriginaire des Amériques où il occasionne des dégâts importants sur diverses cultures le nématode phytoparasite Nacobbus aberrans est un ravageur potentiellement dangereux pour les pays ou les zones encore indemnes comme l'Europe. Afin d'éviter son introduction et d'évaluer le risque représenté par ce ravageur inscrit sur les listes de quarantaine européennes, il est indispensable de mieux cerner les contours de ce complexe d'espèces et de déterminer certains facteurs clefs de sa biologie. Dans un premier temps nous avons évalué en conditions de laboratoire les capacités de différentes populations de N. aberrans à se développer sur différentes cultures. La nature du parasitisme varie selon le couple hôte-population de nématode étudié et corrobore la notion de race physiologique. En outre une catégorie de plantes qualifiées de réservoirs a été identifiée. Elle permet au nématode d'y réaliser son développement jusqu'au stade J4, stade qui se maintient en état de dormance sans assurer la multiplication de l'espèce. Un type original chez les Tylenchides de parasitisme du second stade juvénile a été caractérisé avec le recours à un puits métabolique et l'induction de la synthèse de plastes d'amidon par les cellules adjacentes au nématode. Dans un deuxième temps la variabilité génétique du nématode a été appréhendée d'une part l'étude du caryotype, qui se révèle varier entre 6 et 8 chromosomes à l'état haploïde, d'autre part par l'analyse de l'ensemble de la zone ITS de l'ADN ribosomique. Cette dernière nous a permis de mettre en évidence l'existence de deux groupes distincts au sein du complexe actuellement identifié comme N. aberrans. La reconstruction phylogénétique d'un des groupes a permis de proposer un scénario évolutif impliquant l'apparition d'évènements d'insertions-délétions au sein de la région ITS d'un groupe puis l'apparition d'évènements d'insertions-délétions au sein de la région ITS d'un groupe, puis d'hybridations entre plusieurs groupes divergents