Analyse des motifs régulateurs d'expression dans la famille multigénique de gènes WAKs chez le peuplier

MasterLes protéines WAKs (pour Wall-Associated Kinases) ont une structure transmembranaire avec une partie extracellulaire liée à la paroi et une partie kinase intracellulaire. Cette caractéristique structurelle fait d'elles des candidates pour intervenir dans la transduction de signaux pariétaux. Chez Populus, les protéines WAKs sont codées par une famille multigénique de 175 membres. Ces gènes sont différentiellement exprimés en réponse à différentes conditions comme l'attaque d'un pathogène, l'inclinaison et les carences minérales. Afin de progresser dans la compréhension des rôles des différents membres de cette famille, nous avons initié une étude de régions régulatrices de la transcription au niveau du promoteur (1000 pb) et du premier intron. Les outils bio-informatiques utilisés ont permis d'analyser ces séquences régulatrices, et de réaliser une corrélation entre les motifs retrouvés et l’expression des WAKs en réponse à différentes contraintes environnementales. Cent douze motifs sont représentés significativement dans ces 2 régions régulatrices. Une corrélation a été mise en évidence entre le motif RGWCGTG et une stimulation gravitropique. De même, le motif AWTTCAAA semblerait être lié au changement d’état de turgescence foliaire. Ces résultats préliminaires permettent d'avancer dans la connaissance de cette large famille multigénique chez Populus trichocarpa