Systematische Analyse der Genexpressionsmuster in epithelialen Ovarialkarzinomen durch Differential Display

Durch den Vergleich der Genexpression in Tumorgewebe und Normalepithel von Patientinnen mit epithelialen Ovarialkarzinomen gelang es, mit dem Verfahren des Differential Displays, unterschiedlich exprimierte Gene zu identifizieren, die an der Entstehung von Ovarialtumoren beteiligt sein könnten. Die gefundenen Unterschiede wurden durch quantitative PCR mit genspezifischen Primern an mehreren Patientinnen bestätigt. Eine Gruppe dieser Gene kodiert für Komponenten von Signalübertragungswegen. Dazu gehören die kleine GTPase K-ras, Prefoldin5/c-Myc bindendes Protein MM-1, eine kleine GTPase, die in der Literatur noch nicht beschrieben wurde, Rabin3 und ein neues Protein, das vermutlich Bindungspartner einer Kinase ist. Der offene Leseraster des vermutlichen Kinase- Bindungspartners wurde durch Amplifikation von cDNA-Enden und Datenbankvergleich vervollständigt. Das Gen besteht aus mindestens 20 Exons und umfaßt etwa 165 kb. Es liegt in der Chromosomenbande 12q23-24.1 und kodiert für ein Transkript von 2999 bp. Das Protein ist 657 AS-Reste lang und besitzt eine Größe von etwa 74 kDa. Der vorhergesagte IEP des Proteins liegt bei 4,79. Das Protein wurde rekombinant exprimiert. Es besitzt eine globuläre Struktur und verfügt über eine pleckstrin-homologe- und eine Phsophotyrosin-Bindungs-Domäne, die eine Interaktion mit der Plasmamembran und mit Kinasen wahrscheinlich erscheinen lassen. Ein weiteres Gen kodiert für ein Protein mit vier ds RNA Bindungs-Domänen. Das Gen liegt in der Chromosomenbande 8q13 und besteht aus mehr als 14 Exons. Es kodiert für ein Transkript von 2968 bp. Aus der Nt-Sequenz des 1710 bp langen offenen Leserasters konnte die AS-Sequenz des Proteins abgeleitet werden. Das Protein umfaßt demnach 570 AS-Rereste und besitzt ein MW von etwa 63 kDa sowie einen IEP von 10,4. Es könnte, wie das Staufen-Protein, das ebenfalls solche Domänen trägt, am Transport und der Lokalisation von mRNA beteiligt sein