Técnicas utilizadas no diagnóstico microbiológico das infeções urinárias no laboratório de microbiologia

Tese de mestrado, Microbiologia Clínica e Doenças Infecciosas Emergentes, Universidade de Lisboa, Faculdade de Medicina, 2020O presente relatório de estágio, aborda acerca das técnicas de diagnóstico microbiológico das infeções do trato urinário utilizadas no Laboratório de Microbiologia do Serviço de Patologia Clínica do Centro Hospitalar Universitário Lisboa Norte, onde após uma breve caracterização do local do estágio, são abordados alguns aspetos ligados ao trato urinário, assim como sua anatomia, fisiologia e suas caraterísticas patológicas, No relatório foram descritos todos os métodos e equipamentos utilizados no setor de microbiologia, particularmente na área de diagnóstico das infeções do trato urinário. O estágio foi realizado no período de 6 meses, onde inicialmente foram realizados alguns enquadramentos teóricos acerca do funcionamento, estrutura do laboratório e acerca das infeções do trato urinário, assim como de todos os procedimentos analíticos a realizar. Na fase pré-analítica foram descritas as técnicas de colheita da urina, os frascos adequados e os cuidados a ter com a amostra, assim como também foram adquiridos conhecimentos acerca do processo de triagem, rejeição e conservação da amostra. Na fase analítica foram descritas as técnicas utilizadas para o diagnóstico das ITUs, começando pelo rastreio que é realizado por intermédio de um equipamento automatizado de citometria de fluxo ‟Sysmex UF 1000i”, a urocultura que é feita em meio de gelose sangue e macConkey, nesta fase também é realizada a coloração de Gram que serve para diferenciar as bactérias Gram negativo das Gram positivo. São realizadas também algumas provas rápidas de identificação, como a prova da catalase, oxidase e a prova de filamentação. Abordou-se também ainda na fase analítica os equipamentos automatizados utilizados para a identificação dos microrganismos responsáveis pelas infeções do trato urinário e os seus respetivos antibiogramas. Na fase pós-analítica foi realizado o segmento da emissão dos resultados e validação dos mesmos.This internship report discusses the techniques of microbiological diagnosis of urinary tract infections used in the Microbiology Laboratory of the Centro Hospitalar Universitario Lisboa Norte, where after a brief characterization of the internship site, are addressed some aspects related to the urinary tract, as well as its anatomy, physiology and pathological characteristics, The report will describe all the methods and equipment used in the microbiology sector, particularly in the area of diagnosis of urinary tract infections. The internship was performed in the period of 6 months, where initially some theoretical frameworks were performed about the functioning, structure of the laboratory and about urinary tract infections, as well as all the analytical procedures to be carried out. In the pre-analytical phase, we described the techniques used for the diagnosis of ITUs, beginning with the screening that is performed through an automated flow cytometry equipment ‟ Sysmex UF 1000i ", the uroculture that is made in the medium of blood agar and MacConkey agar , at this stage is also performed the Gram staining that serves to differentiate Gram-negative bacteria from Gram-positive. Some rapid identification tests, such as catalase, oxidase and filamentation test, are also carried out. The automated equipment used for the identification of microorganisms responsible for urinary tract infections and their respective antibiograms was also approached in the analytical phase. In the post-analytical phase the results emission and validation were performed