Estudo da frequência de infeções por Neisseria Gonorrhoeae e prevalência de resistência aos antimicrobianos

Tese de mestrado, Análises Clínicas, Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia, 2018Neisseria gonorrhoeae é uma bactéria que infeta exclusivamente o Homem, transmite-se por contacto sexual e é responsável pela gonorreia, que se caracteriza por uretrite, cervicite, faringite ou proctite. Segundo a Organização Mundial de Saúde, as infeções gonocócicas representam 78 milhões dos cerca de 357 milhões de novos casos de infeções sexualmente transmissíveis (ISTs) curáveis que ocorrem em todo o mundo a cada ano. Para além da elevada incidência de infeções por N. gonorrhoeae, esta bactéria evidencia uma capacidade extraordinária de desenvolver resistências a múltiplas classes de antibióticos, este processo de resistência é mediado quer por cromossomas quer por plasmídeos. Na primeira parte deste estudo foi analisada a frequência de infeções gonocócicas e o perfil de resistências numa população de utentes que recorreu a um laboratório de ambulatório entre Janeiro de 2007 e Dezembro de 2016. Foram analisadas um total de 163 976 amostras e obtiveram-se 444 (0,27%) amostras positivas para N. gonorrhoeae com uma maior frequência de infeções no homem (0,22%) do que na mulher (0,05%). Os dados do estudo revelaram um aumento do número de infeções gonocócicas de 2007 (20 casos - 0,12%) para 2016 (92 casos - 0,57%) e evidenciaram que as infeções ocorreram em maior número no grupo etário dos 20-24 anos. O estudo de suscetibilidade realizado nas 444 amostras positivas para a N. gonorrhoeae demonstrou um aumento evidente da resistência quer à Ciprofloxacina (45% para 70%) como à Penicilina (65% para 83%) de 2007 para 2016, respetivamente. No que se refere à Ceftriaxona, não foram encontradas resistências. Adicionalmente ao estudo anterior, foram investigadas possíveis alterações ao nível genético que possam ocorrer em N. gonorrhoeae após a transmissão entre parceiros sexuais e durante o processo de infeção homem/mulher, tendo em conta as diferentes características inerentes aos hospedeiros dos dois géneros. Para realizar este estudo foi aplicada a técnica de sequenciação total do genoma (Whole Genome Sequencing – WGS). A análise da sequência genética total do cromossoma de cada estirpe confirmou que os parceiros estavam infetados com a mesma estirpe de N. gonorrhoeae. A comparação dos genomas totais de cada par de parceiros revelou a inexistência de perda ou ganho de material genético. No entanto, foi possível observar diferenças genéticas sob a forma de mutações pontuais quando se comparou as estirpes dos mesmos parceiros. Estes resultados indicam a possibilidade de haver genes que a bactéria necessita de modificar de forma a se adaptar a ambientes diferentes durante o processo de infeção homem/mulher para promover a sua sobrevivência.Neisseria gonorrhoeae is a bacterium that infects only human, transmitted by sexual contact and responsible for gonorrhea, which is characterized by urethritis, cervicitis, proctitis or pharyngitis. According to the World Health Organization, the gonococcal infections represent 78 million of about 357 million new cases of curable sexually transmitted infections (STIs) that occur each year around the world. In addition to the high incidence of infections by N. gonorrhoeae, these bacteria shows extraordinary capacity to develop resistance to multiple classes of antibiotics, this process is mediated either by chromosomes or plasmids. In the first part of this study it was analyzed the frequency of gonococcal infections and the profile of resistance in a population of outpatient laboratory users between January 2007 and December 2016. A total of 163 976 samples were analyzed and 444 positive samples were obtained (0.27%) for N. gonorrhoeae, with an increased frequency of infections in men’s (0.22%) than in women (0.05%). The data of the study revealed a significant increase in the number of gonococcal infections in 2007 (20 cases-0.12%) for 2016 (92 cases-0.57%) and showed that the infections occurred in greater numbers in the age group of 20-24 years. The susceptibility study performed in 444 positive samples for N. gonorrhoeae showed a clear increase of resistance to Ciprofloxacin (45% to 70%) to penicillin (65% to 83 %) from 2007 to 2016, respectively. With regard to the Ceftriaxone, resistance was not found. In addition to the previous study, it was intended to investigate possible changes at the genetic level that may occur in N. gonorrhoeae after transmission between sexual partners and to the effect it was applied the Whole Genome Sequencing – WGS technique. The analysis of the total genetic sequence of chromosome of each strain confirmed that the partners were infected with the same strain of N. gonorrhoeae. Comparison of total genomes of each pair of partners revealed that there is no loss or gain of genetic material. However, it was possible to observe genetic differences in the form of point mutations when compared strains of the same partners. These results indicate the possibility of genes that the bacteria need to change in order to adapt to different environments during the infection process man/woman to promote their survival