Several decades after the discovery of the first debris disks and exoplanets, lots of questions remain regarding the mechanisms of formation and evolution of planetary systems. The recent progress of high-resolution high-contrast direct imaging, illustrated by the instruments VLT/SPHERE and Gemini/GPI, enables to unveil the outer architecture (> 5 au) of young ( 5 ua) des systèmes extrasolaires jeunes (< 200 Myr), à un âge où les interactions dynamiques sont encore fréquentes. Mon travail de thèse apporte un éclairage sur l'origine et les mécanismes d'évolution dynamique des systèmes planétaires à travers l'étude détaillée de systèmes clefs résolus par SPHERE et le développement d'outils de modélisations dédiés.La première partie de ce manu...