Associação do polimorfismo c1858t do gene ptpn22 com lúpus eritematoso sistêmico em Santa Catarina, Brasil

TCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Biologia.Lúpus Eritematoso Sistêmico (LES) é uma doença autoimune crônica, caracterizada pela presença de autoanticorpos antinucleares que levam à inflamação tecidual em múltiplos órgãos. Fatores genéticos, ambientais e fisiológicos interagem para o seu desenvolvimento. Um dos genes que pode estar envolvido no aparecimento de LES é o gene PTPN22, que codifica a proteína Lyp, relacionada à regulação do sistema imune. O SNP rs2476601 deste gene resulta na transição de citosina para timina na posição 1858 (C1858T), o que provoca substituição do aminoácido arginina para triptofano na posição 620 (R620W) da proteína Lyp. Essa substituição altera a função catalítica da proteína, o que pode afetar a resposta efetiva do sistema imunológico. Com base nessas informações, este estudo pretendeu determinar as frequências alélicas e genotípicas do polimorfismo rs2476601 e analisar sua associação com a doença em indivíduos moradores do estado de Santa Catarina, Brasil. Para a realização do estudo, foram coletados sangue, do qual foi extraído DNA para posterior genotipagem por PCR-RFLP e dados epidemiológicos de 155 pacientes e 227 controles.. As frequências alélicas e genotípicas foram obtidas e as últimas foram testadas para o EHW. A análise estatística foi feita através do teste de Odds Ratio (OR), com intervalo de confiança (IC) de 95% e limite de significância em p≤ 0,05. No presente estudo, casos e controles estão em EHW (pcasos=0,379; pcontroles= 0,445) e a distribuição dos genótipos e alelos está diferenciada entre casos e controles (χ2= 9,55905; p=0,008/ χ2= 11,37976; p= 0,003). Foi encontrada associação da presença do alelo T com LES (OR=2,236; p=0,011; IC95%= 1,189-4,221), mas não com os dados clínicos estudados. O hábito tabagista (OR=2,217; p=0,007; IC95%= 1,232- 3,997), assim como o tabagismo em indivíduos que possuíam o alelo T (OR=11,019; p=0,019; IC95%= 1,301-248,790) se mostraram associados com a doença. Desta forma, este trabalho conclui que o SNP rs2476601, assim como o hábito tabagista, separadamente ou agrupados, estão associados ao desenvolvimento do LES.Systemic Lupus Erythematosus (SLE) is a chronic autoimmune disease, characterized by the existence of antinuclear autoantibodies, which trigger tissue inflammation in multiple organs. Genetic, environmental, and physiologic factors interact to develop the disease. One gene that can be evolved in the onset of the disease is PTPN22 gene, which codifies Lyp protein, strongly linked in T cell activation. The SNP rs2476601 of this gene results in transition of cytosine for thymine in the position 1858 (C1858T), causing substitution of arginine by tryptophan aminoacid (R620W) in the Lyp protein. This substitution alters the catalytic function of the protein, which may affect the effective response of the immune system. Based on these knowledges, this study aimed to determinate the allele and genotype frequencies of rs2476601 polymorphism and analyze its association with disease in individuals living in the state of Santa Catarina, Brazil. To accomplish this study, blood and epidemiological data were collected from 155 patients and 227 controls. DNA was extracted from blood to gene genotyping by PCR-RFLP. Allelic and genotypic frequencies were obtained and the last one was tested for EHW. Statistical analyzes were done by Odds Ratio (OR) with confidence interval (CI) of 95% and threshold for significance of p≤ 0.05. In this study, cases and controls are in EHW (pcases= 0.379; pcontrols= 0.445) and the genotypic and allelic distribution is dispair in cases and controls (χ2= 9.55905; p=0.008/ χ2= 11.37976; p= 0.003). It was found association between the T allele of C1858T polymorphism and SLE (OR=2.236; p=0.011; IC95%=1.189- 4.221), but not with clinical data. Smoking was associated with the disease (OR=2.217; p=0.007; IC95%= 1.232-3.997) as well as the presence of the T allele of the studied polymorphism and smoking together (OR=11.019; p=0.019; IC95%= 1.301-248.790). Therefore, this study concludes that the polymorphism rs2476601, likewise smoking, separated or combined, are associated with SLE development