Análise do polimorfismo ptpn22 c1858t por high resolution melting em pacientes com artrite reumatoide

TCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Biologia.Introdução: A utilização do polimorfismo PTPN22 C1858T (rs2476601) como marcador da Artrite Reumatoide (AR) tem sido investigada em diversas populações e até o momento não havia sido verificada na população brasileira. Dentre as técnicas descritas para identificação de SNPs, o High Resolution Melting (HRM) se destaca como um dos métodos mais adequados para uso no diagnóstico molecular de doenças. Objetivos: Verificar a associação do polimorfismo PTPN22 C1858T à AR através de um estudo caso-controle e padronizar a técnica de HRM para detecção deste SNP. Metodologia: O SNP PTPN22 C1858T foi genotipado por HRM em 100 pacientes com AR e em 100 indivíduos controles. Os resultados obtidos foram confirmados por PCR-RFLP. Análises do estudo caso-controle foram calculadas por regressão logística binária no programa SPSS v.12.0; p≤0,05, IC95%. Resultados: A técnica de HRM foi padronizada e permitiu a identificação do polimorfismo estudado. A frequência do alelo de risco (1858T) foi de 0,090 em casos e 0,045 em controles. As populações estavam em Equilíbrio de Hardy Weinberg. Não foi encontrada associação entre o alelo 1858T e a predisposição à AR (OR = 2,120; IC95% 0,919 - 4,890; p = 0,078) ou entre este e os demais fatores analisados (tabagismo e fatores hormonais). Conclusões: As condições experimentais determinadas neste estudo permitiram a detecção do SNP PTPN22 C1858T pela técnica de HRM e a análise da associação deste polimorfismo à população brasileira com AR. Não foi encontrada associação entre 1858T e a susceptibilidade à AR, porém, em função de sua importância na doença e da baixa frequência do alelo de risco verificada novos estudos são necessários na população brasileira com AR.Introduction: The use of the polymorphism PTPN22 C1858T (rs2476601) like a Rheumatoid Arthritis (RA) marker has been investigated in many populations and until now it has not been analyzed in Brazilian population. Among the technologies described for SNPs identification the High Resolution Melting (HRM) is one the most suitable methods for use in disease molecular diagnosis. Objectives: To verify the association of the PTPN22 C1858T polymorphism with RA in a case-control study and to standardize the HRM technique for the detection this SNP Methodology: The SNP PTPN22 C1858T was genotyped by HRM in 100 RA patients and in 100 healthy individuals. The genotypes were confirmed by PCR-RFLP. Study case-control analyses were calculated by logistic regression in the software SPSS v.12.0; p≤0, 05, CI 95%. Results: The HRM technique has been standardized and enabled the identification of polymorphism studied. The risk allele (1858T) frequency was 0,090 in cases and 0,045 in controls. The populations were in Hardy Weinberg Equilibrium. No association was found between the 1858T allele and the susceptibility to RA (OR = 2,120; CI95% 0,919 - 4,890; p = 0,078) or between this and the others analyzed factors (smoking and hormonal factors). Conclusions: The experimental conditions determined in this study enabled the SNP PTPN22 C1858T detection by HRM technique and the association analysis this polymorphism in RA Brazilian population. No association was found between the 1858T allele and the RA susceptibility, however due to their importance in disease and the low frequency of the risk allele verified further studies are need in the RA Brazilian population