Caractérisation d'un élément riborégulateur impliqué dans la régulation du métabolisme de l'adénine

Comment une simple molécule peut-elle contenir l'information nécessaire et le potentiel de permettre le développement de la vie? La vie étant un processus très complexe, il va de soi qu'il y a une multitude de mécanismes impliqués entre cette molécule initiale et la présence d'un être vivant. Cette molécule qui contient l'information génétique doit être multipliée, manipulée et transformée afin de permettre le développement de cette vie. Tous les processus physiologiques impliqués doivent être guidés, contrôlés, car il est impératif de maintenir l'homéostasie, de maintenir l'équilibre de fonctionnement. La régulation de l'expression génétique peut se faire par de nombreux mécanismes, en réponse à une multitude de stimuli, assurée principalement par l'action des protéines. Ces protéines, résultant du message génétique contenu dans les gènes, assurent d'ailleurs l'essentiel des fonctions de la cellule. Il appert donc que les mécanismes de régulation ont longtemps été considérés comme étant uniquement l'affaire des protéines. Au début des années 2000, un nouveau mécanisme de régulation a été mis à jour : la régulation des gènes par l'entremise des ARNm appelée la riborégulation. Ce mécanisme consiste en des structures d'ARNm capables de lier de petits métabolites et de moduler l'expression des gènes. Ces structures sont appelées des riborégulateurs et il en existe plusieurs classes et l'on peut les retrouver dans une multitude d'organismes. C'est ainsi que depuis quelques années, plusieurs équipes de recherche caractérisent le fonctionnement de la riborégulation par le biais de l'analyse structurale et fonctionnelle de chaque classe de riborégulateurs. Mes travaux s'inscrivent dans ce cadre de recherche, mais visent plus particulièrement l'étude du riborégulateur adénine. Les résultats présentés dans ce mémoire se situent tout droit dans cette lignée. En effet, l'objectif des travaux effectués était de caractériser un élément riborégulateur impliqué dans la régulation de l'adénine. Pour ce faire, deux approches différentes ont été utilisées. La première consistait en l'étude mutationnelle du riborégulateur à l'aide d'un système rapporteur à chez la bactérie Bacillus subtilis . La deuxième approche consistait à étudier le mécanisme de repliement du riborégulateur adénine pendant la transcription en adaptant une technique d'élongation par étapes développée récemment