Effect of brain regions coordinates selection on dynamic causal modelling results

Diplomová práce je cílena na seznámení se s principy měření a zpracování dat funkční magnetické rezonance se zaměřením na analýzu efektivní konektivity metodou dynamického kauzálního modelování (DCM). Praktická část zahrnuje tři hlavní tematické okruhy týkající se popisu zpracování a vyhodnocení naměřených či simulovaných dat. Nejdříve je zde na vzorovém datasetu ukázáno jak v neurovědním toolboxu SPM analyzovat naměřená data. Dále navazuje návrh přístupu, pomocí kterého lze vyšetřovat chování odhadu modelu DCM s ohledem na změnu vstupních parametrů. Tento jev je také simulován a na základě dosažených výsledků se doporučuje optimální postup analyzování efektivní konektivity pomocí dynamického kauzálního modelování u skupiny subjektů. Posledním okruhem v praktické části je hodnocení vlivu posunu souřadnic mozkových oblastí na výsledky dynamického kauzálního modelování u skupiny subjektů z dat získaných z reálných měření. V závěru práce jsou hodnoceny a diskutovány jak výsledky získané ze simulovaných dat, tak výsledky získané z naměřených dat.Master’s thesis is aimed at familiarization with the principles of measurement and data processing functional magnetic resonance, focusing on the analysis of effective connectivity using dynamic causal modelling (DCM). The practical part includes three main thematic areas relating to the description of the processing and evaluation of measured or simulated data. First, there is on sample dataset described the neuroscientific SPM toolbox to analyze measured data. Then follows introduction of the proposed approach with which is investigated the behavior of the model estimation neural interactions with respect to the change of input parameters. This phenomenon is also simulated and on base of achieved results is recommended optimal approach to analyzing effective connectivity using dynamic causal modeling for the group of subjects. The last circuit in the practical part is assessment of shift the coordinates of brain areas on dynamic causal modelling results for the group of subjects from the data obtained from real measurements. Obtained results from simulated data and the results obtained from measured data are evaluated and discussed in the final part.