학위논문 (박사)-- 서울대학교 대학원 농업생명과학대학 식물생산과학부, 2017. 8. 고희종.C3G(Cyanidin 3-Glucoside)는 검정색 종피 유색미의 주요색소인 안토시아닌을 구성하는 주요성분이며 항산화능력이 우수하고 흑자색미 색소의 주 구성성이다. C3G 함량에 관여하는 양적형질 유전자좌(QTL)와 후보유전자를 찾기 위해 연구를 수행하였다. C3GHi 품종에 흑진주와 수원425를 부본으로 하는 교배조합을 만들어 Backcrossed RILs 유전분석 집단을 육성하였다. 각 조합은 F2 세대에서 SSD(Single Seed Descent) 방법으로 F5 세대까지 세대진전을 진행하였고 F5 세대 RILs 집단에서 각 개체별로 기초농업형질인 간장, 수장, 수수를 조사하고 수확하여 C3G 함량을 측정하였다. 집단의 개체수와 C3G함량의 분포도를 비교하여 C3GHi/Suwon 425 집단을 분석집단으로 사용하였다. 유전분석 방법은 NGS(Next Generation Sequencing) 기술을 이용한 GBS(Genotyping by Sequencing)를 이용하였다. GBS 방법을 통해 총 6,703개의 SNPs가 탐색되었다. 이중 무의미하거나 중첩되는 SNP 마커들을 제외하는 선별 작업을 거쳐 475개의 의미 있는 SNP 마커를 선별하였다. 선별된 475개의 SNP 마커의 염기서열 위치를 이용하여 물리지도(Physical map)를 작성하고 SNP 마커의 유전자형을 토대로 연관지도(Linkage map)를 구성하였...